丁巳三月，宣内阁臣徐溥、刘健、李东阳、谢迁至文华殿。上曰：“近前。”于是直叩御榻，司礼监诸太监环跪于案侧。上曰：“看文书。”诸太监取本付溥等，又分置朱砚笔，授片纸数幅。上曰：“与先生辈计较。”薄等看毕，相与议定批辞，以次陈奏，得允，乃录于纸上以进。上览毕，亲批本，而或更三二字，或删去二三句，皆应手疾书，宸翰清逸，略无疑滞。有山西巡抚官本，上顾曰：“欲提问一副总兵，该提否？”溥等对曰：“此事轻，副总兵恐不必提，止提都指挥以下三人可也。”上曰：“然。边情事重，小官亦不可提耳。”又礼部本拟一“是”字，上曰：“天下事亦大，还看本内事情，若止批一‘是’字，恐有遗失。”因取本阅之，则曰：“是只须一字足矣。”又一本，健奏曰：“此本事多，臣等将下，细看拟奏。”上曰：“文书尚多，都要一看，下去也是闲，就此商量，岂不好？”皆应曰：“诺。”上指余本，谓左右曰：“此皆常行事，不过‘该衙门知道’耳。”乃皆叩头退。上复顾左右曰：“吃茶。”出文华门，尚膳官监捧茶以俟。韦太监喜曰：“茶已具矣。”盖时出忽召，未有宿办也。东阳《燕对录》曰：“自天顺至今四十年，先帝及今上之初，间尝召内阁，不过一二语。是日经筵罢，有此召，因得以窥天质之明睿，庙算之周详，圣心之仁厚，有不可测量者如此。”
戊午六月，南京并苏、松、常、镇、嘉、湖、杭州、徽州诸处河港潭池井沼，水急泛溢二三尺许。似潮非潮，天亦无雨。沿海去处，约有四尺，千里相应。岂蛟龙妖异所致，抑水为阴物，过多失常为灾也？
庚申六月，陕西西安府县道安里军士毛志学于本里赵纶村泥水河边澡浴，得古玉。其色纯白无瑕，光彩异常，厚一寸，背有螭纽，纽高二寸，方圆一尺四寸，棱角完好，无损缺，其文曰：“受命于天，既寿永昌。”巡抚都御史熊翀等以献于朝，议欲称贺。郎中陈仁等建言此不足信，况亡秦之物不足为重。遂已之。
庚申六月，召内阁诸臣至平台，上出诸营提督官辞任本，各议去留。大学士刘健请上裁决，上取英国公张懋本，令拟旨留之。及保国公朱晖、惠安伯张伟，皆然。至成山伯王镛、宁晋伯刘福，皆准辞退。问曰：“何如？”刘健等皆应曰：“圣览极当。”皆拟旨讫。又问：“新宁伯谭祐，较之刘福如何？”盖祐时亦有言其短长者。李东阳对曰：“谭祐在营管事，似胜刘福。”上意亦以为然，但止可令管神机营，提督团营须另选，可令镇远侯顾溥代之，因问溥如何。刘健等皆应曰：“溥在湖广甚好。”李东阳曰：“况新有贵州功。”上曰：“然则令管神机营。”李东阳曰：“谭祐掌神机营久，但系伯爵，若与薄同营，即当为副。溥虽侯爵，但新自外入。若令管五军营，名在张懋次，而令张伟，似于事体稍便。”上从之，即令撰手敕稿。是日司礼惟二太监在侍，余无一人在左右者。于是扶安、李璋举小红卓，具朱笔砚，李东阳录稿以进。上亲书手敕成，付司礼监官。李东阳复奏曰：“今边方多事，皇上留意武臣，亲赐黜陟，臣等不胜瞻仰。”皆叩头出。时已召兵部尚书马文升等候于左顺门，候敕出行之。
旧例通政司奏事，各衙门承旨，惟刑部、都察院同为一法司，并立听候。如旨云“法司知道”，两衙门俱跪而应。若止云“刑部知道”，惟刑部堂上官承旨。云“都察院知道”，惟都察院官承旨。玉音微低，不免混听，则具本认罪。时白司寇昂每次不差，闵都御史珪屡差，俱蒙温旨不究。李阁老东阳与闵俱甲申进士，因会同年席上谓闵曰：“今早年兄何以又差？”闵答曰：“某一时听不真。”李曰；“白公只有一耳，何以听真？年兄有两耳，何听不真？”众皆愕然。李徐笑曰：“刑部字止一耳，都察院非两耳而何？”一座辗然称善。
上厌阉竖专擅，将责任大臣。乃御文华殿，召吏部尚书屠滽，谓曰：“治国以御边为急，御边以粮饷为要。今各边总督粮草官，若侍郎、参政、都指挥各一员，都是混管，不分勤惰，以致功罪赏罚，往往失当。老尚书与朕分派地方，使各有所总，而勤惰功罪，因有可考，赏罚亦可施行。”即授简与滽，滽惭赧，久不能对，阉竖皆掩口窃笑。上复谓滽曰：“汝畏人怨耶？朕将自定之。”即将户部侍郎使统千里，参政、都指挥各统数百里。命自大同、宣府抵宁夏，溪山险阻，某处则搭木乘渡，某处则作梯飞挽，庶士卒不疲，而粮饷易集。睿算井井，若目中事。而侍郎等皆悦服，领敕而去。滽亦赐茶，命还部。上既入内，以滽不副旨，怏怏终夕。至是召见大臣鲜矣。凡遇大事，上径自裁之。
辛酉冬，马司马文升转太宰。御史张津、文森、曾大有论马宜在兵部，且熟知边事，吏部宜慎择正人居之。奏上，奏旨：“进退大臣，朝廷自有公道。这御史每如何辄擅铨衡？皆下狱送法司拟罪。”佥谓辄擅铨衡，准律文其罪不小，皆为危之。后得旨如拟，运炭还职。方知上意初未尝怒言者，恐论列者众，故先批如此。圣人之度，何尝有所适莫哉！方太宰缺时，马与刑部闵珪皆以资望相应，北人主于马，南人主闵。推者以马为首，遂相嫌。马在部，移怒于属司，一年之间，刑部十三司无一转官者，可谓隘矣。弘治末，为何御史天衢所劾，遂罢去。
京师好事者扶鸾，有降笔诗：“江山何日许重来？白骨青林事可哀。吾党莫言清梦返，海东东更有蓬莱。”又云：“斯文古今一堪哀，道学真传已作灰。鸿雁未高罗网合，麒麟偶见信时猜。迅雷不启金縢惑，紫电谁怜武库才？于此可知同气数，浑沦来往共盈亏。”莫知为何人作。扣之，复书曰：“予篁墩学士也。”是时程已没久，其诗类其早年所为，盖其拂郁不平之气，犹有未散焉者。先是，己未春，程敏政与李西涯同主考礼闱，其第三问策题程所出，以四子造诣为问。许鲁斋一段出刘静修《退斋记》，士子多不通晓。程得一卷，甚异之，将以为魁。而京城内外盛传其人先得题意，乃程有所私，为华给事中昶等所劾，谓私徐经、唐寅等。上命李公覆阅，迟三日始揭晓。言路复论列，欲穷治之。上怒，下都给事中林延玉等于狱，落言官数人职。而程亦致仕以去，亦一时文运之玷云。
太监李广以左道见宠任，权倾中外，大臣多贿求之。戊午岁，建毓秀亭于万岁山上，既成后，适一小公主患痘疮，众医莫效。广饮以符水，遂殇。宫中方归咎于广。未几，清宁宫灾，有谓亭之建，年月不利，犯坐杀向太岁，故有此灾。皇太后怒云：“今日李广，明日李广，兴工动土，致此灾祸。累朝所积，一旦灰烬！”广惧，饮鸠死。上意其藏必有奇方秘书，即令内侍搜索。奉命者遂封其外宅，搜得一帙纳贿簿，首进之。簿中所载某送黄米几百石，某送白米几千石，通计数百万石。黄米即金，白米即银。上因悟广赃滥如此，遂籍没之。科道请出簿究问，凡与名者，惶惧危甚，各自星夜赴戚畹求救，不期而会者凡十三人。月下见轿影重重，而一人独乘女轿。事虽得寝不究，而纳贿之名，一一盛传于朝野。腆颜虽甚，久而亦安然无复羞愧矣。时若屠太宰滽、徐宗伯琼、白司寇昂、沈通政禄、陈瑶诸人，为尤著。上英明，终渐去之。
北虏火筛寇边，势甚猖獗。马钧阳文升以少傅兼太子太傅为兵书，朝廷特所倚重，命阅兵于教场，又命司礼监太监李荣同阅。马欲与李并坐，往返言再三，荣竟不允。遂各居一幕，而递阅之。夫以保傅之官，掌本兵之柄，又值弘治之世，而宦官乃若此，其可骇也矣。
太皇太后一日谕上，欲召崇王入朝。上意以太后注念，将从之。复以事体重大，乃令礼部会九卿科道等官集议。时议者不一，展转久之。给事中屈伸援引故事，谓不宜擅离封守，遂已之。
上勤政，每日清晨视朝，遇雨则免。仍令有事衙门堂上官，由廊庑升奉天门奏事。或因走急滑跌，上多不问。尝以通政司、鸿胪寺官奉事繁难，若差错一二字者，有旨不必纠奏。经筵诸讲官失仪，尤加宽慰。闸朝有不到者，多从宽宥，不得已罚俸一月。其体念臣下之仁至矣。
辛酉秋，华容刘大夏自两广召至京，升兵部尚书。既受职，一日上召至幄中，问曰：“朕累召用尔，尔因何累以疾辞？”大夏对曰：“臣待罪两广，委的年老多病。况见近年四方人穷财尽，易于生变，兵部掌朝廷机务，万一变生，臣才不足以了此事，忧惧不敢来。”上默然久之，曰：“尔乃尽心办事。”大夏叩头退。越数日，又召问曰：“尔言天下民穷财尽，自祖宗以来，征科赋敛，俱有常制，何以近年民穷财尽？”大厦对曰：“近年征敛，恐不止于常制。姑以臣巡抚地方言之，如广西取铎木，广东取香料，费用钱粮，动以万计。”上曰：“铎木是军中要用的急务，不得已取之。尔尝奏来，已令停止了。今后但有分外的征敛，便令该衙门来说，再斟酌定夺。”
北虏骄横，各边俱有警报。时上以兵事属意于太监苗逵，与逵谋欲举兵出塞，劫虏营。谋已决，而英国公张懋、兵部尚书刘大夏俱不知。苗逵先与刘大夏在教场论兵事不合，心知二人不欲此举，密告于上。乃召大夏论曰：“尔在两广，来时苗逵等于延绥河套阴劫虏营，由是虏不敢犯边。尔知之否？”不夏对云：“尝闻从征将士言劫虏营时事，当时全仗朝廷威德，幸而逃脱，不然全军覆没于境外，未可以为善。”上曰：“永乐中频年出塞破虏，今何不可？”大夏对曰：“皇上神武，固同于太宗皇帝，奈今之将领、兵力，远有所不逮。且在当时，如国公丘福，稍违节制，遂令数万兵俱陷虏地，况今之将又在丘福之下。不若令各边将料敌战守，犹似得策。”时左都御史戴珊在侧，极赞大夏言为是。上遽曰：“微尔二人之言，朕几为人所误！”遂寝其谋。大夏等叹曰：“上之听言从善，如转环若。是前代英君谊主所不能及也。”
上无日不视朝。或三五日朝罢鞭响，上起立宝座上，高声：“兵部来！”于是尚书刘大夏跪承旨，由西陛以进。上退立宝座后，大夏迳造上前，语移时。群臣侍班观望，人人欣戴。间或宣都察院，于是左都御史戴珊亦承旨由西陛而登，上立宝座后，或坐辇中，与二臣相与商榷大事，多或移一二时方退。间亦召吏书马文升与语，然比二公稍疏。其与刘公语，尝令左右却立，有欲尽削内官权柄。当时灭九门监门官，及禁革过取商税，皆本于此。其朝臣无大小，皆乐趋朝，以仰承德意。间有语及早朝事，不能答者，就知其懒于朝矣。人自愧悔，盖有不令而自不能安寝者也。
刑部尚书闵珪谳狱不称旨，上怒甚。一日与尚书刘大夏论及之。刘与闵同年交厚，且知其为人，欲解救之，而未敢言。俟上谕毕，对曰：“法司执法，恩归朝廷，似未可深怪。”上曰：“尔第云古昔何人如此执法？”大夏见圣怒，莫知所对。上诘之，对曰：“尝闻孟子云：舜为天子，皋陶为士，执之而已。”上默然久之，怒意未解。大夏窃意所对欠避讳，心悔其失。上徐曰：“朕亦知闵珪是老成人物，欲求一人以易之，不可得。但此事执之太过耳。”明日奏下，允刑部之议。吁！上之明烛人心，而强于从善如此。
上尝召问天下卫所军士何如，大夏对曰：“与民一般穷，安得养其锐气！”上曰：“在卫俱有月粮，征戍又有行粮，何以也穷？”大夏对曰：“自江南卫所困于运粮，江北卫所困于京操。运粮有脚价、还债之费，京操有做工、部料之费。此外浪费，犹有臣等不可知者，所以俱穷。”上曰：“朕在位许多年，不知天下军民都这等穷。”叹息久之。越数日，诏令各衙门凡损于军民弊政，俱备查奏。