上一日召刘尚书大夏，谕曰：“朕尝欲于附近东西地方，各操人马一枝，以为京师左右掖，何如？”大夏对曰：“保定止是一府地方，独设一都司，统五卫在彼。仰思祖宗之心，恐亦是此意。”未几，一御史陈言，议欲发回各处轮班京操官军，因拟将保定两班一万人回卫团操。奏入，上可之，遂敕令京营都指挥戴仪往任其事。人不知此出自上意，遂有造飞语者，揭帖子于宫门相诬。上取帖子付太监苗逵，令出以示大夏。明日上复召，面谕之曰：“宫门前岂外人可到？必是忿不得私役此军者所为。”大夏叩头谢。时京东军亦于密云、蓟州责成巡抚官，城堡已备，因兵力未集，其事竟废。
《问刑条例》成于弘治庚申，先是有诏，谓：“近例太多，人难遵守，三法司查议停当刊布。”于是尚书白昂，侍郎屠勋、何鉴，都御史闵珪、侣钟，大理卿王轼等，会委御史王鼎、王恩，郎中杨茂仁等，查出会议，开例以上。再命会同吏部等衙门覆议。皆已停当，白刑书又题请刊行，永为遵守。未几，白去位，闵代之。议者纷纷，给事中孙祯、葛嵩、徐昂等则谓“私役军伴”、“立嗣择立贤能及所亲爱”、“典当田地已勾本利交还原主”等项是起争端，而王府又奏郡王、将军妾媵定数及冒支官粮之类，皆非所以待宗室，将示与庶民无异，要行革去。奏下，多以为宜改。而致仕阁老尹直复贻书当道，以为前日诸臣刑名欠精，率多窒碍，徒为诲淫长奸之地。时诸司议亦不同。予同年沈员外文华时管章奏，为闵所重。予谓沈曰：“今若改一条，其余皆不可存矣。岂永为遵守之意哉？”众以为然。乃质诸闵公，遂覆奏云：“前例数条，委皆停当，但近年奉法者率多拘泥牵合，以致有言。”乃申明数语，稍加增润上清，遂得俞允。其覆“宗支繁衍，与国初不同。与其犯之而后治以法，非惟无益于事，而伤恩亦多矣；固欲先事豫防，其保全敦睦，皆深意所存，是古先宫中府中一体之义”，尤为亲切。群议乃寝。
上一日宣内阁臣，谕曰：“辽东张天祥事，东厂缉事揭帖云：“当时御史王献臣止凭一指挥告诱杀情词，吴一贯等亦不曾亲到彼处，止凭参政甯举等勘报，事多不实。”今欲一干人犯提解来京，令锦衣卫于午门前会问，方见端的。”大学士刘健等皆对曰：“如此固好。”上以揭帖付健曰：“先生辈将去整理。”健等退，具揭帖云：“都察院本既已批出，东厂揭帖又不可批行，须待会勘，至日再议。”次日，上又召内阁、兵部来至门上。兵部选镇抚司理刑官毕健等人，至暖阁。上盛气曰：“张天祥事秘密未行，先生辈昨所进揭帖，祗合亲书密进，如何令书办官代写？”健等皆叩头曰：“东厂揭帖已封定，不曾令书办官见之。”上曰：“阁下揭帖内乃有‘提解来京’等语，此事尚未行，且欲解京者，正欲明白其事，先生辈固以为不可行，何也？”健等对曰：“臣等非敢阴解京，但无故传旨，事体未便，故欲少待会勘耳。”上曰：“此事已两番三次，何为非阻？”皆对曰：“此事已经法司勘问，皆公卿士大夫，言足取信。”上曰：“先生辈且未可如此说，法司官若不停当，其身家尚未可保，又可信乎？”大学士李东阳对曰：“士大夫未必可尽信，但可信者多，其负朝廷者不过十中一二耳。”大学士谢迁对曰：“事须从众论，一二人之言恐未可深信。”上曰：“先生辈此言皆说不得，此事密切，令人到彼处体访得来，谁敢欺也？”皆对曰：“此事干证皆在彼处，恐劳人动众耳。”上曰：“此乃大狱，虽千人亦须来，若事不明白，边将谁肯效死？”健等皆对曰：“赏罚朝廷大典，臣等愚见，正欲皇上明赏耳。”上曰：赏罚事重，朕不敢私，但欲得其实情。若果系扑杀，贪功启衅，岂可从之？若果有功被诬，须为伸雪。”语久，龙颜少霁，曰：“须传旨行之。”皆应而出。后又复召，上从容问曰：“昨因张天祥事，先生辈言文职官不负朝廷，亦不应如此说，文官虽是读书明理，亦尽有不守法度者。”健等皆对曰：“臣等一时愚昧，干冒天威。”东阳曰：“臣等非敢谓其皆不负国，但负国者亦少。”迁曰：“文官负国者，臣等亦不敢庇护，必欲从公处置。”上笑曰：“亦非谓庇护，但言其皆能守法，则不可耳。”因谓：“此事当如何发？初欲传旨，先生辈谓别无事由，猝然改命。猝者，暴疾之意，此亦未为猝也。”如是者再。皆应声曰：“臣等见都察院本已批出无行，只欲事安稳耳。”上曰：“缉访之事，祖宗以来，亦有旧规。今令东厂具所缉事，题本批行。”皆对曰：“不如传旨。”上乃命拟旨，提解至京。上新御午门城上，锦衣卫引囚至，上令三法司都御史戴珊等鞠问回奏。大概谓前事乃以匿名文书而行。上遽曰：“匿名文书，见者即当烧毁，此系律文。如何辄以施行？”群臣皆慑伏，莫敢仰对。遂决其狱，重轻有差，吴一贯等皆落职。
上锐意兴革，一日召刘尚书大夏至幄中，谕曰：“各衙门应诏查出弊政，虽具准行，然未有及内府事者。朕闻在内弊政莫甚于御马监、光禄寺，且言官亦尝论及，朕将亲理焉。”大夏对曰：“此皆干系内府，必须皇上见定而自主之。”异日遣科道官同兵部侍郎各一员，奉敕往清其事。既而二处减去浪费，每月以白金计之，各不下十余万两。
上复虑天下有司多不得人，乃召戴都御史珊及刘尚书大夏同至幄中，谕曰：“尔等与各科道官观朕图治的说话，虽都准行去了，然使天下府州县亲民官非人，未必不为文具，百姓安得被其恩泽？欲令吏部择其贤否黜陟，然天下官多，难得停留。细思之，莫若自今与尔等访察各处巡按二司官，先当以此辈黜陟停留。尔珊更慎择各处巡按御史，然后责他们去拣择府州县卫所。官得其人，人受其福。庶几行去的说话，不为文具也。”二人叩头退，因与同列共叹曰：“尧舜知人安民之德，不过如此。”
户部主事李梦阳言事，语侵宫禁左右太迫，下锦衣狱。越数日，上召刘尚书大夏议边事，言毕，谕曰：“李梦阳后生无涵养，进言大戆，因令下狱。有告朕避罪谏官之名，免付法司议拟，止欲杖而放之。尔以为何如？”刘仓卒未及对，上遽曰：“此言岂真爱朝廷之好心，不过致彼于死以快私忿耳！”大夏叩头谢曰：“圣明洞见人心如此，岂徒言事之臣之幸！”既而即有旨释放复职。此乾坤包含之仁，今古鲜俪也。梦阳初为户曹，怏怏不乐。考满日，尚书侣公钟署其考曰：“一官不满其心，三差不终其事。”人以为然。梦阳之疏，盖有所激之耳。然其负才使气，习与性成。后迁提学副使，乃挟制抚按，凌轧僚友，又与逆藩交通，猬兴大狱。勘官参其士行有亏，亦不诬也。
乙丑五月，上不豫。初六日早，司礼监太监戴义宣内阁臣直至御榻。上著黄袍，便服坐榻中，南面。大学士刘健等叩头，上令近前者再。既近榻，又曰：“上来。”于是直叩榻下。上曰：“朕承祖宗大统，在位十八年，今年三十六岁，乃得此疾，殆不能兴，故与先生每相见。”时上玉色发赤，火声盛气。健等皆对曰：“陛下万寿无疆，偶尔违和，暂须调摄，安得遽为此言？”上曰：“朕自知之。亦有天命，不可强也。”因呼水嗽口，掌御药事太监张愉取金盂盛水，以青布拭舌，劝上进药，不答。愉曰：“再进此一服，即无事矣。”上曰：“朕为祖宗守法度，不敢怠玩。凡天下事，先生每多费心，我知道。”因执健手，若将永诀者。上又曰：“朕蒙皇考厚恩，选张氏为皇后，成化二十三年□月□日成婚。至弘治四年九月二十四日生东宫，今十五岁矣，尚未选婚。社稷事重，可亟令礼部举行。”皆应曰：“诺。”时司礼监太监陈宽、李荣、萧敬等以次毕至，皆罗跪榻外。上曰：“授遗旨。”扶安、李璋捧笔砚，戴义就榻前书之。上又曰：“东宫聪明，但年幼好逸乐，先生每请他出来读些书，辅导他做个好人。”健等皆叩头仰奏曰：“臣等敢不尽力。”上复加慰谕而退。
乙丑冬，初建泰陵，时都下盛传其地有水，吏部杨主事子器直言其事。时督工太监李兴素有殊宠，势焰薰灼，遂下杨锦衣狱，莫敢救。适有起复知县丘泰，莆田人，到京上疏言：“杨某此奏甚有益。盖泰陵有水，通京师皆云。使此时畏而不言，万一梓宫葬后有言者，欲开则泄灵气，不开则抱终天。今开看无水，此疑遂释。故云有益。”灵遣司礼监押杨往，众谓杨必遭兴毒手。及至，兴率奴客骂詈，欲捶杨。司礼监太监萧敬则曰：“水之有无，视之即见，李哥何必粗躁！”取茶出曰：“杨先生来换茶。”又顾李曰：“他士大夫，可杀不可辱。”遂得免。回奏实无水。杨榜甚重，众又谓杨必至降谪，刑部拟奏。太皇太后闻之，曰：“他秀才官，说有水也是他的意，如今没水便罢，如何只要摆布他？”遂得免罪。可谓不偶然矣。杨，慈谿人，好古而有文学，尝三作县，俱有異政，但性稍偏，虽数言事，鲜知大体，惟此奏为人所难也。
时拟上尊谥庙号，礼官集议，以上仁圣，近代罕比，难于模写。欲拟谥上“敬”字、庙上“孝”字，或以为未足。内阁有云：“孝为百行之首，敬为万善之源，实不可易也。”议遂定。亦实录云。