顺治十一年甲午〈（附称永历八年）〉正月，成功因李德述其父芝龙所属“如未投诚，先献监国鲁王”之故，乃令杨致护送鲁王，从海道诣广西路路陛见以避之。王踌躇不欲行，功强之再四，王始扬帆。至海表遇风，回居南澳。
二月，芝龙复遣李德同郑、贤二使斋‘海澄公’印敕来闽招抚。总督刘清泰亦致书成功，其略云：“幸一时旷荡之恩，出自宸聪怀柔之略，真千载一时矣。今大势所在，不待智者而决。川、湖之捷屡奏，两粤之叛尽归。近而舟山遁迹，远而全姜覆车，徒有荆棘在。足下以孑然一旅，孤悬海外，纵使楼橹是凭，亦无分茅割地之实际；将谓踞岛而守，终属依山傍海之游魂。今固山开镇于漳滨，江南劲旅、北地满兵，络绎奔赴。馀波一日不靖，全师一日不班。无论扬帆击楫，可以灭迹犁庭；即安坐以折窥岸之谋，密布以塞通津之径。想足下此中之生聚教养，万不得以暂持久、以劳待逸、以不足待有馀；不几望洋而成竭泽，浇树而致焚林？此非不佞震喝之言，而确乎理势之谈也。若肯乘此毅然来归，翻然号泣，召族党部曲而论之，各鼓化其心，以了立命安身之局。既不辜令亲万里衔书之苦；亦以慰尊公数年欲断之肠。上而朝廷之德意，下而不佞之苦心，可谓不相负矣。然更有为足下思者：将惧投诚而孤注，何妨拥卫其子弟以归；倘怀赴阙为畏途，何妨请命于桑上而守。以不佞半生忠朴，久见谅于圣明，皆能一一代足下剖心呼吁者。从此树奇勋以酬遇，拜爵禄而分藩矣。殊为足下望之。”成功至安平，款待二使。以未有地方安插兵将为辞，复二使，并不受敕印。郑、贾回京。功乘招抚按兵，就福、兴、泉、漳四府征追粮饷，备办船料等项。
三月，定西侯张名振、忠靖伯陈辉帅舟师突入长江，夺船百馀只。犯天津，焚粮艘，次金山寺，设祭崇祯而回。
四月，有谤黄大振欲献海坛投诚者，功信之。领甘辉。黄廷、陈尧策、周全斌等镇，声言巡视，假道海坛。大振前接，功执之归。赐鸩，饮不死；绞杀之。以泉人戴捷为援剿前镇，统其众。
五月，督饷官黄恺，才能滑稽，任意科克。沿海受其凌剥，百姓情急，相率匍控成功。功抚慰之，立收恺，杀以示众。众乃安。
六月、大清封郑芝龙同安侯、郑鸿逵奉化伯、郑芝豹左都督。遣内院学士叶成格、理事官阿山同芝龙第西子〈（名渡）〉赍四府安插兵将敕命入闽。
八月，总督刘清泰再修书赍到，云：“赍到敕印，不佞既庆其事之确遵命尊于君之间、父子之际，实费大力苦心。但敕印久为虚悬，其事势既已垂成，何必稍存芥蒂？且敕中“归顺人数，具奏安插地方，会同督、抚详细报闻。”何不斟酌，次第商及乎？今一拜诏，不但足下可以特疏，不佞亦当补牍。倘必缓成命以俟议、待家书而入告，在足下多一番形迹，在尊翁多一番畴躇。此不佞半夜代筹，至愚至笃之论，想英雄豁达之见，亦不以为其意之迂且浅也？不佞濡笔以俟裁决，万勿游移耳？所言取饷事，不佞亦效一得焉。今日联异姓于同丹、化国家于骨肉，则地方者各有关系之地方也、人民者各有联属之人民也。留得一人，他日多一豢养；留一土地，他日多中生聚。况足下于桑梓姻友之间，更须调护者，又无烦不佞之谆恳矣。不佞以侍从之旧人，偶莅封疆，去就裕如；但得始终此事，自不贪以为己功，但可告无罪于尊翁握手时，则厚幸矣！馀何计哉？”差官杨茂同李德、周继武来厦见成功。功询其父平安毕，随问此来情由。继武曰：“叶、阿赍四府安插部文。太师差武等求藩主：早归顺一日，则太师早受一日安福。”成功点首而已。即差吕太同周继武、李德入泉州，讲叶、阿二大人面议。
九月初七日，渡舍到厦门。功出接见，抱痛分离之苦，自极诚切。次早遣渡舍先往安平侯二大人。随调甘辉、王秀奇、陈尧策、万礼、蓝衍、苏茂、黄梧、周全赋、杨文灿、吴豪、萧泗、林明、杨祥、黄山、黄廷、萧拱宸、黄昭、蓝登、黄六御、郑文、蔡禄、郭义等镇并水师诸将，咸往安平。列营数十里，旗帜飞扬，盔甲鲜明。密布锹黎鹿角，设伏据隘，好似铁桶。成功同诸参军然后进发。
十七日，叶成格，阿山到安平，住报恩寺。其随从精骑数千、步旅万馀，漫山遍野札营，了哨四出，各相提防。成功请先开读诏书酌议，方肯薙发。成格与山欲成功先薙发，然后接诏。互争数日未定。二十二月，功以叶、阿无定见，再约二十五日面会确商。二十四日清晨，兵马悉撤，二大人不辞成功而回泉。功接报，笑曰：“忽焉而来，忽焉而去，举动乖张。但因一人在北，不得不暂作痴呆耳。”即差林侯同渡舍尾后抵泉，请二大人示下，并送厚礼。成格坚欲先薙发方许接诏；未薙发，非臣也，焉肯轻出诏书？功又差史谠入泉，再请二大人，问其“诏书未开，未知是何意见？且未知诏书中是何说话。薙发之事，发落岂能易长乎？”成格立逐史谠出城；令拨什库看守郑渡，随即取讨夫马上京。谠回详陈。成功与诸参军议曰：“观叶、阿二使，便知清朝无真心待我。盖欲效前日勒太师故态，赚吾接旨，乘其不意而擒。后见本藩布置周密，甲兵雄壮，无计可施，拙然归去。岂真有敕书哉？”
其奉差黄六表，闻叶、阿二大人已回京，即辞成功，功亦不留。表乞回书，功不允。六表跪恳再三曰：“太师朝夕南望！岂有表等回都，竟无只字，可乎？”功意稍解，信笔报其父曰：“儿戊子年差王裕入京问候父亲福履，以致父亲被围、王裕被擒。从此而后，只字不敢相通，恐有贻累也。至壬辰年杪，忽周继武等赍父亲之信，儿且骇且疑。既而李业师等赍书继至，儿疑信参半；乃差李德入京，实前传闻父亲不讳，试往觇之果在与否？修禀聊述素志，和议非本心也。不然，岂有甘受招抚，而词意如彼？岂有欲尽忠而又能尽孝；此不待明言而可知矣。不意海澄公之命突至，儿不得已按兵以示信；继而四府之命又至，儿又不得已接诏以示信。至于请益地方，原为安插数十万兵将，固图善后至计；何以曰“词语多乖，征求无厌”？又不意地方无加增，而四府竟为画饼！欲效前赚吾父故智，不出儿平日所料。遽然薙发，三军为之冲冠。陆嗟！自古英雄豪杰，以德服其心；利不得而动之，害不得而怵之。清朝之予地方，将以利饵乎？儿之请地方，将以利动乎？在清朝罗人才以巩封疆，当不吝土地，在儿安兵将、绥民生，将必藉土地；在清朝总以削发为是，在儿总以不剃发为是。天下间岂有非其臣，而轻从其利者乎？天下间岂有彼不以实许，而此以实应者乎？天下间岂有未相信以心，而先信以发者乎？天下间岂有事体未明，而可糊涂易貌者乎？大丈夫作事，磊磊落落，毫无暧昧，清朝若能信儿言，则为清人，屈于吾父为孝；若不信儿言，则为明臣，尽于吾君为忠。人生在世，不过此忠孝二字而已；此八月十九日，在、德，周继武等自京回至中左，诏使抵省，渡弟同李德、周继武等与叶、阿相让：‘欲照前郑、贾例，俟儿差人去请，然后下来’。正欲差官往省敦请，报诏使已于念四日到泉矣。侦其到泉，的确九月初四日辰时。郎差李德同吕太往泉送礼。渡弟初七日来见，十一日即回。儿嘱其致意集、阿，约期相面而叶、阿于十七日随到安平，盛设供帐于报恩寺。乃叶阿不敢信宿，哨马匹出，布帐山坡，举动十分疑忌。敕书委之草莽，成何事体？且奉敕堂堂正正而来。安用生疑？彼既生疑，儿安能无疑乎？儿再差林候送礼，回称‘叶寺阿二大人，念五日的的相见’。继而周继武来报：‘叶、阿二位决欲先薙发，然后接诏’，其诏亦安在安平署中。且薙发万分大事，非容易苟且，须与叶、阿二位面议十分妥当，奉旨命下，然后可。儿犹恐周继武传述失实，各书一藁为据，再差史谠同渡弟进城，再请叶、阿来安平面议。念九日叶、阿逐史谠等回。文接周继武、李德来禀云：“武等念九早见二位大人，被他兜留。仍差拨什库管押渡弟，催迫起身，不容刻缓。于午刻，二大人先出东门，立唤德等齐行。德等称说夫役未便，限三十早起身。三十日商时，李春、吴文榜等来报：‘叶、阿二位大人于九月念九午回省去矣’。盖叶、阿身为大臣，奉敕入闽，不惟传宣德意，亦将以奠安兆民。今百姓如此困苦、将士如此蕃多，在泉月馀，目睹脱巾情形，未曾与儿商榷，徒以‘薙发’二字相逼挟。儿一薙发，即令诘将薙发乎？即令数十万兵皆薙发乎？即令千百万百姓俱薙发乎？一旦突然尽落其形，能保其不激变乎？叶、阿二位不为胎终之图，代国家虚心相商；而徒噪气相加！即李德亦儿差也，不令之来，而挟之去。使臣尚如此行动，朝廷可知也；能令人无危乎？能令人无惧乎？况儿名闻四海，若使苟且从事，不特不见重于清朝，亦贻笑于天下后世矣。大抵清朝外以礼貌待吾父，内实以奇货居吾少。此番之敕书，与叶、阿之举动，明明欲借父以挟子；一挟则无所不挟，儿岂可挟之人乎？且吾父往见贝勒之时，已入彀中。其得全至今者，大幸也。万一父一不幸，天也！命也！儿只有缟素复仇，以结忠孝之局耳！又据都督府行文各府，备办马料，策应大兵。李德、周继武来禀：‘孟兵部领兵已到仙霞’。此即是前日之部院、金固山一攻一和；叶、阿此番布置，一剃一挟，前后同一撒也。儿此时惟有秣厉以待，他何言哉？儿本不敢具禀，缘黄六表痛哭流涕，必欲得儿一字回复。姑详悉颠末，统惟尊慈垂照！”书毕，又与其弟渡书白：“兄弟隔别数载，聚首几日，忽然被挟而去，天耶！命耶！弟之多方规谏，继以痛哭，可谓无所不至矣！而兄之忠贞自持，不特利害不足以动吾心；即斧钺相加，亦不能少移吾志也。何则？决之己早而筹之已熟矣。今兄之心绪尽在父亲禀中、弟阅之，可以了然矣。夫凤凰翱翔千仞之上，悠悠于宇宙之间，任其纵横所之者，超超然脱乎世俗之外也。兄名闻四海，用兵老矣，岂有含凤凰而就虎豹者哉？惟吾弟善事父亲，厥尽孝道，从此之后勿以兄为念！”书毕，交黄六表启行。功遂添设炮台，大整舟师，以备征战。遣林察督王秀、苏茂等五链，配战舰五十只，护送监督林云璇赍动王本，从海道诣广西行在；并书会李定国合师。
十月，漳州总兵张世耀当中有楼总刘国轩，说其左营游击林世用归海。用许之，轩至厦门，先见参军冯澄世。世喜轩材貌雄伟，遂留与谈时事，大有经济。世甚器党之。轩感世之知己，拜世为义父。世引轩见成功，功大悦。令轩秘之速归，看东门浦头若有连珠火箭起，便是兵到，郎当应之。轩回报世用，复说合魏其志、杨标合谋〈（国轩，汀州府长汀县赖坑人，面带枣色，雄伟魁梧。胸藏韬略，不得志于世。见知于漳镇左营游击林世用。用委为漳州城北门楼总。楼总者，耑司城门也。后轩投诚，授为天津卫总兵）〉。
十一月初一日，成功令洪旭、甘辉、林胜、陈尧策、陈斌、戴捷等坐快哨，入海澄。连夜至浦头，放号箭，国轩应之。世耀仓卒乃降。功得捷报，于初四日亲到漳州。以刘国轩为护卫后镇、魏其志为火武镇、林世用为木武镇，张世耀为监督。礼待知府房星烨、龙溪县知县周琼、县丞李馥等，各原职办事。时同知、通判缺室，后诸县悉附成功，功以南靖知县李奇为同知，漳浦知县范进为通判。
成功既得漳州，遣甘辉、周全斌、陈尧策、郝文兴诸镇分道统众，旁攻属邑。诸邑惊惶，咸归附焉。而泉属诸邑亦望风投降，独泉州城守韩尚亮与施郎结为刎颈交，即教其开壕筑台，拥兵坚守。成功令人说之，不下。郝文兴请为先锋领兵攻击。成功戒之曰：“善战不如善守，彼恃其城坚固。若使四方悉归，谅彼亦在囊中物耳。姑置之，毋损士卒。”令甘辉统诸镇取仙游。辉至，仙游县知县陈有虞与城守率兵民拒之。辉令架云梯四面交攻，城上用炮石火罐打下，一时不能克，反伤士卒甚多。辉大悒快，有神器镇洪善献计曰：“此城乃葫芦穴也，可用滚地龙破之；不可以精壮之兵驱之攻城，徒损士卒。”辉大喜，即揖问洪善求计。善曰：“乘此年杪，元旦在即，且缓其攻。而懈彼心。可令各镇挑壕筑堑，堤防周密，作久困计。此城东门外有三官常一座，甚大，可以堆积馀土。就其内暗开地道，作葫芦口，直通城下，安放火乐、火桶诸物在内。再用大竹通其节目，藏药线作心，而达于外。然后堆上填石，以塞其口。将兵马撤开，烧着火心，火然药发，城立破矣。”辉大喜曰：“此计大妙，烦尔监督。”善领命，就于三官堂内调度开凿地道。
顺治十二年乙未〈（附称永历九年）〉正月初四日，洪善回复“地道已经完备，请元帅发令。”辉遣中协陈谦领兵马为先锋，看今夜火发城崩，其势稍止，乘便而入；其馀将士悉撤开埋伏。是夜辉令周围掌号呐喊，城内疑为攻城，各饱食登城，以备守御。至二更，善烧着火心。少顷，霹雳一声，如天崩地裂，烟灰蔽天，飞石遍野，城裂百有馀丈，兵民死者不计。少顷稍止，陈谦督兵进城。辉亦领各镇砍四门而入。知县陈有虞闻城破，自缢而死。天明，甘辉安民毕。先是，甲午年十一月朔日，有个不衫不履丐者，左手持双筷、右手执一碗，将筷打碗，从东北走过西门，又从北门走过南门。如此者三日，忽然不见。人咸不解，多以为狂。独有林姓一人，忙挈家逃匿山中。及城破之后，方忆前日之丐者乃与人也。持筷打碗，犹旋东西南北而走者，明是指人“快快走”也。但时人愚不知，惜哉〈（附记：右都督黄廷统十八银攻粤东潮之饶平县鸟石楼。其石楼小而且坚，内请平和人朱亮为师，指画守御之策。廷百计放之：不下，反失银将江龙。是时洪善亦在其间，廷令善开滚地龙。亮观其攻打少缓，举动可疑，讶曰：“必用滚地龙法也！”楼中人民惊惶。亮曰：“毋忧！可周围放缸盛水，他若果用滚地龙，其水必动。”既而，果见东南角缸水不时摇动。亮就动处令人凿去，就地将所填火桶、地雷尽行搬出；然后填塞其道。迨及发火，寂然无声。不但不破其楼，而且助其许多火药。廷知内有能入，遂撤师而回。故为将者不在兵多，实在算胜。观朱亮之调度料敌，可见为将之一斑。惜其不用于世而泯没也！）〉
甘辉既得仙游，遣人报捷，屯札城中。闻油潭里活阎罗王志章有先知识，斋戒往谒，行弟子礼。叩间其平生、功名、寿算如何。志章书一帖示之，乃“位至崇明，转至崇明”八个字。辉拜受而宝藏之〈（辉后果位至中提督，永历封为崇明伯。从成功犯江南，由崇明县而入，被梁化凤所执，不屈而死，功痛惜之）〉。辉措征粮饷船料，携尚书唐显悦全家出厦门。
二月，太监刘玉自安隆所奉永历诏，从粤东龙门航海到厦，成功率文武恭迎跪接。宣读毕，遂请帝安，并询：“迩来恢复事体如何？”玉对曰：“定南王孔有德征粤西，分师从衡州、宝庆、永州而进，旋为李定国所败，帝于是稍安。但孙可望与李定国二人恃功，骄悍不睦，终非国家之福。”成功曰：“当此之际，内无贤相匡其君，而运筹帷幄乏其人；外有骄将，兵无纪律；又不积储粮饷以足兵食，谋扼险阻以图恢复；而乃恃功立党，致使英雄失望，人心瓦解，将何以望中兴哉？”玉顿首曰：“藩主所言，可谓明见万里！”功又问：“龙门一路，行走阻滞若何？”玉曰：“乘间溃，乡人相引，尚可往来。”功时以事系，而无专卖，随设六官董理：用潘庚锺为吏官、郑擎柱为礼官、洪旭为户官、陈宝钥为协理礼官〈（钥字蓼屏，隆武举人，系泉之晋江人）〉，以张光启为兵官、程应璠为刑官〈（璠，浙江人，武进士，官都督，甚有机略经济之才）〉，以冯澄世为工官、常寿宁为察言司。又设‘储贤’、‘育材’二馆。令思朋州知州邓会劝学取士，得黄带臣、洪初辟等四十人，次第转六官之内办事；或外为监纪，或为推官、通判不等。
四月，擢郝文兴为左提督、万礼为后提督。政王秀奇为右提督、林胜为戎旗镇、黄昌为援剿左镇、黄梧为前冲镇。筑浯州新城。
五月，南征勤王，总督林察、周瑞等舟师次虎头门。侦知李定国战败、梧州失守，不敢进兵，还师。功责其迟滞失策，各戴罪立功。加都事吴慎为户官。议北上恢复，拜定西侯张名振为元帅，忠靖伯陈辉副之，统二十四镇入长江。加户官洪旭为水师右军、北镇陈六御为五军戎政同行，相机进兵。又遣中提督甘辉为总督，王秀奇副之，领二十镇，为北上应援。前提督黄廷为帅，后提督万礼副之，领二十镇南下。甘辉舟师将至舟山，遇暴风，收入温、台地方。台州总兵马信遣心腹将王英驰书币交好约降，未果。辉仍将舟师出，令拱旭于舟山由岑江口登岸。守兵无几，不敢交战，弃垒遁，报镇将巴臣功〈（功，山西人，勇猛机谋）〉，遂分兵守御，遣人请援。既而张名振、阮骏、陈六御、周瑞等咸顺风毕至，分道堵截，攻击不息。六御遣监督李化龙招臣功，臣功忖不能守，遂降。迨至同师，甘辉引见成功。功授臣功为铁骑镇。改名“臣兴”，接定北将车。令陈六御等统师至舟山协守〈（六御，都督陈谦之子，颇有勇略，后卒于战功。用其弟陈为言为总兵）〉。
六月，孟兵部至福州。总督李卒泰遣官赍书至厦门说成功曰：“激切再书，无非早定海上之议、早报圣明之念，以早结尊公父子忠孝之局耳。何足下举动依然毫厘千里耶？天下事，情理与势耳。尊公位列大臣之上，令祖母年迫风烛之期：念漳、泉寸土，为足下胞胳所瘗，即祖宗庐墓所依，足下咫尺弄兵，荆棘其上；在尊公之魂梦一刻未安，令祖母之寝食户刻不乐！足下将泰然波凑之间，自谓功名富贵之计得乎？此情理之绝无者也。更有虑者，固山枕戈久矣。今大师驻马于漳畔、劲旅露刃于泉南，有不能顷刻待。盖不候意主于抚，固山力主于攻。在足下夸浮恍惚，不佞焉敢执为必抚而止于攻？倘一攻而缓，抚局之成犹可言也。一攻而遂，成抚局之变；则尊公前此之绸谬与不佞后此之挽回，俱无所用矣。此又势之了然者也。足下家报所陈，皆足以启群疑之诽而激圣明之怒。缮疏而入，几费踌躇。然一片苦心，不得不写足下所言再为披沥。所云‘不知有父久矣’；此言一出，不但伤天性之恩，且贻后世之刺。尊公身为明季重臣，国亡而择主，非背国而事仇也。足下前无顾命、今无共主，何得灭不可易之亲，而从不必然之议也？古之求忠臣于孝予者，几无据矣！至今犹屡执此‘三省相畀’之说，胡为乎来哉？今天下中外，帖然十载。而足下身羁海甸，犹欲招徕之。以大一统之势，谁敢取臣服之版图？惟正之赀赋而轻议畀乎？且从来无此庙算、无此边筹也。即如足下所云，亦可笑矣，无三省，则舍我而忠于彼；将有三省，即弃彼而忠于我。此皆拂情影借之言，知非足下之心也。但念朝廷加恩一番、尊公经营一番、不佞来此区画一番，天下事宁可瓦全，勿为玉碎？足下或谋之族党、或谋之老成，务为开心见诚，勿得藏头掩面！勿再以必不可告之言、必不可为之事，徒费口舌、徒滋议论，而终于坐失机会也！不佞言至此，力已竭矣。他日见尊公于斑联之间，亦可告无罪矣。至进止之事，则有固山并诸大人。成败之局，则关乎足下一门父子兄弟。不佞虽膺其职，其肯尽任其咎乎？惟足下裁之！”功览毕，掀髯而笑曰：“彼欲以劲旅挟吾。吾岂惧一固山哉？”厚待其使，答以曰：“叶、阿二大人至京覆命如何，然后再作商量。”不报书。前提督黄廷师从揭阳港登岸，屯札桃花山。潮州总兵刘伯禄进兵救援，列营于鹰嘴浦。左戎旗林胜密令军士每人要沙土一袋，填塞壕沟，砍栅破垒。伯禄果无佣，二更仓卒而遁。廷遂合南澳忠勇侯陈霸等众，围揭阳，守城、知县弃城去。普宁亦继陷。
叶、阿二大人至京覆命。部议以成功骄兵无状，反复不定，置其父同安侯芝龙于高墙、戌其胞叔芝豹于宁古塔〈（豹封澄济伯。因护庇施郎，成功怒之。后见成功以马得功事杀芝莞，其令太严，不私其亲，于是乘招抚，挈龙妻颜氏自安平入泉州投诚，移居京都）〉。又令贝勒世子罗托统满、汉官兵平海至闽。
成功侦知，遂集参军并诸提镇讲曰：“今日招抚不就，贝勒统兵已到，有何良策？”左提督郝文兴挺身曰：“自古道‘水到土压，兵来将当’；此不易之理。今贝勒师来，焉可坐视？兴虽不才，愿为先锋，前去破敌。”陈尧策曰：“策自来愧无寸长，既左提督肯去，策愿同行立功，以图报效。”冯澄世曰：“二公所言，领兵破敌，其气可夺三军，固是为将本分。但彼弓马娴熟，若欲陆战，人马驰驱，诚恐胜负未卜。况彼粮饷充足，四方云集，万一失其锐气，不特人心摇动，而且军威难振。以世管见，不如全师暂退厦门，坚守各岛，养精蓄锐，修备战舰，南北巡视，以待彼军。若论彼兵，水战非其所长。况波恬浪静之时，彼犹有头眩晕吐之苦，安望其能御敌？此乃保全军土，以逸待劳之法也。未知诸公以为何如？”成功曰：“战者譬如逐鹿，未知得于谁手。退者可保无虞，澄世之言实乃料己料人之至论，深合吾意。”遂飞檄与兄泰；先将安平安资，尽移周金门安顿；毁其居第，坠其镇城〈（芝龙置第安平，开通海道，直至其内，可通洋船。亭榭楼台，工巧雕琢，以至石洞花木，甲于泉郡。城外市镇繁华，贸易丛集，不亚于省城）〉。又令杜辉传谕泉属士民：“有显相从者，悉渡金、厦两岛居住，令黄昭拨船接应。如不愿从者，速远避山中，恐遭兵马蹂躏。”高其库藏，坠惠安、同安诸县城为平地。又驰令与林俞卿、林世用等移家眷于海澄，摧漳州府城。成功领兵回厦门，仍遣郝文与统其所部守海澄。擢海澄知县黄维璟为察言司〈（察言可者，稽察各文武得失，即如通政司也）〉，以丙戌举人林昌为海澄知县。差张英督造高崎、竹坑一带沿边炮台烟墩，修拾熕船战舰。通行南澳陈霸，防备碣石苏利、南洋许龙二处会师。又令铜山张进整船宫仔前，以作南澳救援。令陈六御、阮骏、张名振等把守舟山乌洋。调洪旭、甘辉、林胜诸提镇回师。旭次台州港，总兵马胜献城降；同旭回见成功，功授胜中权镇、征卤将军印。
九月，左提督祥符伯郝文兴病故。功哭察甚哀，厚恤其子。令王秀奇代守海澄。
十月，张名振自长江直抵定海关，守关将张鸿德降，功授德前锋镇。
十二月，贝勒提师至泉，大奖韩尚亮坚守功，寻而擢尚亮海坛总兵。贝勒知成功退守金、厦，坠倒诸城，笑曰：“海贼无伎俩矣。”即令府县兼工修筑城池，督造战船。遣使赍谕到厦招成功。功拒而不纳，使者回。贝勒复易函致书，令再往。功厚待某使，以叶、阿前议复之，不报书。