圣祖康熙元年，夏五月，叙平滇功，进封吴三桂亲王。初，世祖定鼎，东南时有不靖，因命定南王孔有德循广西，平南王尚可喜、靖南王耿仲明循广东，平南王吴三桂循四川及云南。及南方略定，命诸王各帅所部绿旗兵，留镇地方。时有德已死，无子，爵除，仲明亦卒，子继茂袭封，于是王云南，可喜继茂王广东，寻从继茂王福建。继茂卒，子精忠嗣，是为三藩并建之始。三桂西征，留长子应熊于京师，以固朝廷意。应熊旋尚主，居京师，朝政巨细，无所不悉。三桂以是包藏祸心，日伺衅以动。世祖宾天，三桂拥兵入临，前驱至燕者。人马塞途，居民走匿，朝廷恐其为变，令于京城外张幕设奠，三桂哭临成礼而去。
六年，秋七月，平西王吴三桂以目疾求解云贵两省事务，许之。帝亲政，欲实行中央集权之制，知藩镇强大非国家之利，阴为之备，而诸藩始不自安。三桂因上疏诡称目疾，疏辞两省事务以相尝试。帝令将该藩所管各项事务责令该督抚管理，其大小文官均由部题授。 九月，云贵总督卞三元，提督张国柱、李本深合词请命平西王吴三桂仍总管滇黔事务，优诏答曰：“该藩自以年国就衰，奏请改派。今若令王复理事务，非所示体恤。遇有军机重要，王自知料理也。”
十二年，春三月，命平南王尚可喜撤藩回辽。时之信失爱于父，可喜欲废之，而立之孝，因疏请归老辽东，留之信镇粤，冀得见帝自陈也。廷议虑之信拥众留粤，跋扈难制，因请令尽从全藩回籍。 秋七月，命靖南王耿精忠统帅藩兵来京候旨，平西王吴三桂移镇山海关外，精忠、三桂闻允撤粤藩，因亦同时疏请安插以探廷旨。时廷议请勿从滇藩，而尚书米思翰明珠、莫洛等则力主同撤。 冬十一月，吴三桂反于云南。时侍郎哲可肯等奉命输撤藩，在滇促行甚急，且时复凌辱其将吏，将吏皆怒，三桂乃下教会诸将曰：“今行期迫矣，朝廷之严谴不可逃也，惟事故君永历帝之陵寝在焉，可无别乎？”诸将皆再拜听命，于是卜日谒陵。先期复集诸将，谓之曰：“别故君当以故君之衣服见，诸君其预图之。”皆曰：“诺。”至日，各具汉官威仪，集陵下，三桂方巾素服，酹酒，山呼再拜，恸哭，伏地不能起。三军皆哭，声震如雷。人怀异志，将行，复称疾不起。抚臣朱国治驱之急，三桂坚卧不应，激诸将曰：“老夫与诸君有大勋于王室，章皇帝不以老臣为不肖，锡之藩封，载在盟府。今抚臣一外吏，相凌乃尔，一旦入圜门，付廷尉，我辈岂有生路耶？！”诸将忿然出，袭执抚臣杀之，三桂乃移檄远近，发兵反，自称天下都招讨兵马大元帅，以明年为周元年。贵州巡抚曹申吉，贵州提督李本深，云南提督张国柱皆起应之。云贵总督甘文焜闻变，自贵阳趋镇远，战败自杀。 十二月，命顺承郡王勒尔锦为宁南靖寇大将军，统师赴荆州讨吴三桂。先遣都统巴尔布等，帅满洲旗兵守常德；都统珠满等，以步兵三千守岳州。都督尼雅翰、赫业席布根、特穆占、佟国瑶等，分驰西安、汉中、安庆、衮州、郧阳、汝宁、南昌诸要地，听调遣。又以滇蜀接壤，命西安将军瓦尔哈，帅骑兵赴川中。
十三年，春正月，吴三桂遣其大将马宝犯湖南，陷沅州常德，澧州、长沙、岳州相继降。同时四川巡抚罗森，提督郑怀麟，总后谭洪、吴之茂，以四川应三桂。 二月，抚蛮将军孙延龄，反于广西，以应吴三桂，三桂封为临江王。延龄为孔有德女四贞之婿，初授和硕额驸、内辅政大臣、都勒机昂邦，世袭一等阿思尼哈番。顺治十七年，授镇守广西将军，寻特进上柱国光禄大夫。三桂反，廷议以广西境邻贵州，授延龄为抚蛮将军，令严兵固守，至是叛，自称安远大将军。 三月，耿精忠据福建反，自称总统天下兵马大将军。裕民元年，分三路出寇，曾养性出东路，据浙之温台；白显忠出西路，据江西广信、建昌、饶州；马九玉出中路，据浙之金严、衢徽。又约台湾郑经、潮州刘进忠，内外夹击广东。帝使其弟聚忠赴闽招谕，至衢州，拒不纳。命内大臣希尔根为定南大将军，帅师讨之。 夏四月，赐吴三桂子应熊及长孙世霖死。时三桂新赴常德督兵，而令其从子应麟守岳州，布重兵于澧州石首华、容松滋间，为犄角，赴剿诸军。云集荆州，无敢遣一旅渡江与之角者。至是命贝勒尚善为安远靖寇大将军，助勒尔锦进图岳州。三桂乃分兵，一由长沙出江西，一由四川窥陕西。其出江西者，分扰袁州吉安境，与耿精忠之军合，陷三十馀城，声势张甚。 秋九月，命安亲王岳乐为定远平寇大将军，帅师赴广东。时潮州总后刘进忠暗通耿精忠，引闽兵入潮州，广西提督马雄、左江总兵郭义，俱降吴三桂，广西全省震动。 冬十二月，帝议亲征。时陕西提督王辅臣叛于宁羌州，劫杀经略莫洛，定西大将军贝勒董额退守汉中。帝切责统兵诸将帅，不遵指授，迁延观望，致有此变，因下亲征之议，后以群臣力谏，乃止。
十五年，春二月，尚之信叛降吴三桂，三桂授之信招讨大将军，封辅德亲王。先是之信之父可喜，因东西受敌，又内制于之信，力不支，乞师往援。诏以镇南将军舒恕、副都统莽依图，引兵赴之。之信闻师至，改帜易服以变，严兵守可喜府，移檄诸郡，出师侵犯江西。可喜寻以忧卒。 六月，抚远大将军都统图海等，击败王辅臣于平凉城北，辅臣降。 秋九月，康亲王杰书兵入闽，破马九玉之众于衢州。时白显忠顿兵广信，穷蹙乞降。 冬十月，杰书兵抵延平，耿精忠降。时精忠两路之师俱覆，又内迫于郑氏，闻延平已失，大惧，遣子显祚赴延平，迎师至福州。精忠帅所属文武出降，帝命还精忠爵，俾乃统其部众。 冬十二月，以额驸耿昭忠为镇阅将军，驻守福州。 是月，吴三桂遣其从孙琮引兵入桂林，擒杀孙延龄。延龄故与马雄有怨，雄既降附三桂，三桂以雄为东路总督。延龄与之共事，而畏其逼己，乃复萌反正之意。其妻孔四贞，日夜以恩德为言，劝其反顺，计已决矣。雄侦知之，𬣙诸三桂，谓延龄有异志，宜急除之，遂被害。
十六年，夏五月，莽依图兵入韶州，尚之信降。先是之信苦三桂征饷，颇萌悔志，至是闻莽依图军至，帅军民迎降。诏之信袭平南王爵。
十七年，春三月，吴三桂称帝于衡州，国号大周，建元昭武，寻改利用。升衡州府为定天府。时三桂既失陕西、福建、广东三大援，又失江西，疆宇日蹙，财力渐竭。知大势已去，恐将士解体，欲伪示威重，以维人心，于是建号改元，置官封拜，颁制新历，举行云贵乡试，以号召远近。三桂初发难时，檄文中以复明为词，于是洛邑顽民，犹思禄父，故义旗一指，所在响应。及闻西南称孤，妄自尊大，由是天下解体，角材而至者，皆思有以诎之矣。 夏六月，吴三桂兵攻永兴，不克，围之。 秋八月，吴三桂卒，孙世璠嗣立，改元洪化，遣将马宝等三面环攻永兴，城垂陷。是役也，三桂以永兴为衡州门户，势在必得。时简亲王喇布军屯茶陵，不敢救，穆占在郴州，遣兵来援，亦不敢进。都统伊里布、副都统哈克山相继战殁，前锋统领硕岱等，协力死守，城屡濒于危。会三桂死，诸将拔营回衡州，围乃解。
十九年，秋八月，平南王和硕额驸尚之信赐死。之信既降，从征广西，驻军宣武。会其弟之孝谋袭藩位，令藩下人张士选赴京控之，谓之信心怀怨望，放言讪上。都统王国栋者，故旗下逃人，之信爱之，倚为心腹，至是亦附之孝，构成罪状，朝命侍郎宣昌河等驰往按问。之信闻诏，即解印还广州，上疏待罪，诏解京对簿。李天植者，藩下总兵也，恶国栋卖主，诱杀之。抚臣金俊，艳之信富，索贿不得，罗致其狱以闻。天植坐谋反伏诛，同死者一百八人，之信赐死，之节、之瑛、之璋、并坐斩。
二十年，冬十月，定远平寇大将军彰泰等，分中路入滇，英世璠自杀，云贵平。初，世璠既立，不敢居衡阳，退驻贵州，恃川湖贵为屏蔽。时湖南有安亲王，广西有傅宏烈等，四川有平凉提督王进宝，陕西提督赵良栋，皆累战累捷。吴应麒自岳州走常德，寻复弃城遁，长衡相继下。同时宏烈等亦攻克桂林，进宝克汉中，王屏藩退守保宁，俄自杀。良栋亦于是时克成都，会朝廷以贝子彰泰代岳乐，进取云贵，命总督蔡毓荣节制汉兵先进，檄广西、四川、陕西三道之师，合趋云贵，而自帅平定湖南之师出沅州，由平越趋贵阳。世璠走云南，遂乘胜西进，与赖塔会师于曲靖。军抵云南，良栋帅川师，与赖塔闽粤之师亦至，合围攻克之，世璠自刎死，云贵悉平。
二十一年，春正月，磔靖南王和硕额驸耿精忠，并斩其子耿显祚，及曾养性、刘进忠等。精忠既降，从康亲王征闽，收复兴化、漳泉等郡，逐郑经入台湾。会其弟昭忠，嗾藩下参领徐鸿弼等，赴部首精忠归顺后，仍蓄不轨之志，同时昭忠亦具疏入告，因召精忠入朝，以其时精忠所属都统马九玉，尚握兵权，不敢据发其罪。及云贵平，九玉解任归旗，始磔精忠于市，三藩悉平，尽籍藩产充饷，撤藩兵回京师，而于各紧要省郡地方，设八旗兵驻防，不复以兵爵土地，世予臣下，于是封建藩之弊绝，而中央集权之制亦渐以完密矣。
编者曰：方藩变之初起也，清廷猜忌汉武臣愈甚，诸路皆以王贝勒督军，诸帅皆纨绔，固不知军旅为何事。及见三桂席卷而出，所至望风归附，诸将亦各怀二心，至有欲举襄阳以北降者。赖绥远将军蔡毓荣持之以免，故屯兵岳州城下，八年不战，诸将皆闭营垒，作壁上观。至三桂死，其兵自退。又闻东西两路，屡次奏捷，始不得已进兵。及事平，诸将皆蒙上赏，而东西两路反有以败亡致罪者。赵良栋被劾几不免，毓荣竟挂吏议，夺爵削职，至披剃九华寺中。