康熙三十四年乙亥正月，谕大学士等：兴永朝前请丈量湖南田地有累于民否，治国之道，莫要于安民，或有不肖州县将田地尽未丈量，辄称余田加赋者，亦未可定，安有加增田赋而全不累民之理，着湖广总督昊琠详察具奏。
二月，贵州巡抚阎兴邦奏：黔南人文繁盛，请依广西乡试解额取中三十名。又疏言：黔省蕞尔会城，附郭新贵、贵筑二县，虽各有职掌，至于编甲、捕盗、通行案缉等件，奉文转发，不得不由县互行一事，而受两番约束，民多未便。每以势逼权分，推委贻误，请裁新贵县，并入贵筑县。再黔处万山中，名为一站，险实千般，各属途程隔二三日或三四日不等，一遇缺员，附近州县在冲衢者，既难舍己从人，其偏僻之区，深箐穷谷，苗蛮出没，刻难共员，又虞鞭长莫及，请于贵阳首府添设通判一员，差委可以迅行，署缺亦无忧兼顾，实于吏治有裨。均下部议行。兵部疏劾正红旗满洲都统建威将军不收人旗拨送马匹，致糜钱粮。得旨革职。赐侍读陈元龙御书凤池良彦额，并御书一卷。厄鲁特噶尔丹遣使入贡疏言：使臣马迪被害，不获详知，难于覆奏，所云约地会盟之事，俟后奏闻，请将喀尔喀七旗发回故土，泽卜尊丹巴及土谢图汗二人亦仍照前奏。上赐敕责之，且云：嗣后若仍怙非不悛，蔑视前谕，永勿许上疏遣使贸易。太和殿兴工。两江总督范承勋疏言：江西有漕粮四十八州县，除南昌、新建二县外，余皆地处山僻，须小船载来至省交兑。粮艘向系民贴脚费，官为解运，嗣因州县恐涉私派，将此载入赋役全书。康熙二十六年经漕臣题参，各省并无支给脚价，以违例照数扣追，今十载无一报完者。若官赔则官已数更，民赔又原系民出，岂可价令赔补？若将脚价停给，则僻处州县之漕更虑迟误，请免追赔，以后仍听支给。部议不准，得旨如所请行。
三月，承勋又疏言：江南下湿，仓谷易腐，请将江苏、安徽等州县捐积仓谷，于每岁青黄不接米贵时，以七分贮仓备赈，三分平粜，秋收以粜银买谷还仓，递年出陈易新。又言：江南财赋甲天下，州县催征不易，旧例接征催官照原参分数处分，嗣后计续完多寡为轻重，如原参欠二分，今已征完一分，即改照未完一分例议处。原参欠一分，今以征完七八厘，即改照未完不及一分例议处。又言：江宁驻防满、汉官兵，岁需粮十六万四千余石，于南屯米内拨解，不敷照时价折给。但各属征解南米在秋收后，而月粮自正月起支，急之则民苦预输，缓之则兵虞乏食。至改折之银，亦须二月开征，俟解到采买已在四五月间，而正二月粮无措，请将安徽所属捐积仓米提解十六万，充江宁现年兵饷，其秋征南米留作不千之用，自此得先征后给，递年相因，庶一应接不敷之患。更请将捐积仓米提十万石存贮省仓，值米贵时减价平粜。又言：江苏额征银每岁三百余万，今各年未完多者二十余万，少者十万有奇，按额计算，每岁所完已在九分以上，逋欠多系贫瘠下户。再漕项钱粮自康熙十八年后积欠甚多，新旧同征，民力难应，请将苏州属县及安徽属六安、寿州、合肥、灵璧、虹县积欠地丁漕粮，分年带征，以纾民力。琉均下部议行。免山西河津、荣河二县本年水冲田亩额赋。
四月初六日，山西平阳府属临汾等十四州县一卫地震，房屋倒坍，人民损伤。寻停收本年钱粮遣大臣赈恤，压死大口给银二两，小口七钱五分，无力修屋者，每户银一两。免福建闽清二县三十三年水灾额赋。
五月，以盛京遇旱，命内阁学士嵩祝同侍郎珠都纳往会将军等支海运存贮米万石，散给贫民，以万石平粜回京。上问盛京各处田禾，嵩祝奏：上下不等，盛京比年失收，今岁虽日有秋，难支来岁。上曰：盛京贮米几何，若散赈可支几月？嵩祝奏：臣等往赈，五十日，所用不至二万石。今天津海口所运及锦州积贮共十二万石，若以赈济，可支六七月。上曰：海运有定时，其令来岁再运。寻命嵩祝同珠都纳往开原等处给散兵米。谕曰：将军等请给米，但言兵丁而已。其陵上执事人及众百姓，并不言及，此皆朕赤子，可一并散给。嵩祝奏：臣等前次散给，正当其乏之时，故计口月给仓米一斗五升，今总发数月，给一斗足矣。上曰：照前给一斗五升，勿减省，可给至来岁四月，尔等亲加覆散。
六月，总漕王梁疏参赣州卫千总杨奉等于漕船装带货物搜出情由。上谕：王梁将漕船所载货物尽行搜出，弃置河岸，所行甚暴。从来未尝禁带货物，而漕运并未迟误。今王梁禁止而漕船至今未到，装带些微货物，于事何妨？王梁不但暴戾，凡事执抝，宜令解任。
七月，噶尔丹遣使上疏，仍如前奏，下敕责之。
八月，上巡塞外。西安将军博（济）［霁］报：噶尔丹属下回子塔什兰和卓等率五百许人过我三岔河讯界，总兵潘育龙擒解前来，请皆拘留，俟得噶尔丹确信，再行遣回。从之。先是，京城预备大兵派为三队，至是上谕曰：闻噶尔丹将从嘉峪关外，过哈密之南，顺克鲁伦及额齐内河往投**喇嘛，果尔此机断不可失，三队兵应作速启行。寻令副都统阿兰达自甘州回西安，将军博霁回宁夏，确探择便以行。先是，密谕科尔沁土谢图亲王沙律曰：噶尔丹人极狡猾，朕欲发兵，恐彼闻风远遁，兵撤则又复来。今噶尔丹遗尔书，可籍此遣人语云，我科尔沁十旗俱附尔，尔可前来，诱至近地，于时朕亲统大军，风驰电击，断可灭矣。至是沙律来朝，遣侍郎西某同往，密授说之之计。尚书班迪报：送文兵报称，回至巴尔察罕，远望厄鲁特兵沿克鲁伦河屯聚甚众。上令增发兵一队。安北将军伯费扬古奏：臣亲率大兵往四子部落苏尼特等处驻劄，相机征剿。
九月，上回官。噶尔丹扰喀尔喀游牧，上命调蒙古各扎萨克兵，以鄂克济哈现赴汛界，所有苏尼特、阿巴噶、阿巴哈纳尔各部兵，命领侍卫内大臣索尔图偕鄂克济哈前往收集，各驻要地侦御。免直隶顺天、保定、河间、永平四府康熙三十五年地丁银米。
十月，以噶尔丹肆掠纳木札尔陀音，派西安、宁夏满汉兵从西路进，京师兵从中路进，乘雪而行，俟到彼时，塞草发青，可以前进。发沙木巴戴青、墨尔根济农并附近喀尔喀诸台吉之兵于诸处防守。班迪报：遣人至克鲁伦河，探得噶尔丹在峨格穆尔布尔哈苏泰度冬，候雪后乃行，约三百户，骆驼牛马千余，绝无羊群，毳幕敝坏。谕议政大臣饬兵预备，设彼于严冬妄进，即行剿减。
十一月己未朔，日食。免宣化府龙门等县三十四年三十五年额赋，以霜灾故也。以山西平阳府地震，诏赦天下。
康熙三十五年二月丙辰，上亲征厄鲁特噶尔丹，六军启行。命内阁学士陶岱以海运至盛京之米，给散科尔沁之贫乏者。先是，噶尔丹自乌兰布通败遁后，仍侵掠我臣服之喀尔喀，潜入巴颜乌兰之地。上密谕科尔沁土谢图亲王沙律遣人约之，噶尔丹果沿克鲁伦河而下，掠喀尔喀纳木札尔陀音，遂据巴颜乌兰。因命安北将军伯费扬古为抚远大将军，从归化城进发，扬威将军觉罗舒恕、西安将军博霁、振武将军孙思克等由镇彝取昆都伦一路，俱于二月二十日前后起程。此皆西路。上自统中路大兵出独石口，将军萨布素统盛京、宁古塔、黑龙江、科尔沁兵沿克鲁伦进。此东路。
三月辛未，由青城驻跸滚诺尔，遇雪，从官及军士服物由车运者，及暮不至，时一等侍卫海清从，上命海清以驰载既至之内府帐房及食物柴炭分赐，令栖息举火。海清寻复奏言：军士因衣服沾湿，寒冽殊甚，且未得爨食者多，得蒙颁给帐房食物柴炭，众皆欢跃，如庆更生。上又谕曰：马又畏寒，其瘦者犹可无恙，肥者或致冻毙，宜顺风驰二三里许，令人围绕之，使气息渐温，则无妨矣，可传谕众知之。
四月二十日己巳，上驻跸西巴尔台。先是，大将军伯费扬古疏言：四月二十四日可到土喇，二十七日可到巴颜乌兰，是以中路大兵振旅安行，期西路兵两路夹进。至是哨探人回言：厄鲁特实在塔尔几尔济，而费扬古奏至，乃云于四月初八日在翁金口东进兵，初十日自乌兰厄鲁几起程，与将军孙思克、博霁一路前进，计本月三十日，可至土喇阿喇克山之西克勒河朔地方，来月初七可至巴颜乌兰。
五月丙辰朔，上驻跸拖陵布喇克，遣使同厄鲁特所获四人，赉敕书赐物谕噶尔丹。我使回侦知噶尔丹所在。壬戌上躬率兵前行，诸军以次进发，抵克鲁伦河，噶尔丹知圣驾亲来大惊，尽弃庐帐器械逃去。甲子，上亲率前锋兵穷追，噶尔丹仓皇遁走，沿途遗弃器物。丁卯，命领侍卫内大臣马思喀为平兆大将军，领兵追剿。上班师，驻跸克勒河朔。癸酉，费扬古捷音至，言军至昭莫多，噶尔丹率贼万计逆战，自未至酉，大败之，剿杀三十余里，斩首二千余级，俘获无算，杀噶尔丹之妻阿奴及贼渠甚众，噶尔丹引数骑逃出。
六月初九日癸巳，上还官，明日行庆贺礼。两江总督范承勋疏言：官兵遇闰添支之粮，江宁驻防于上下两江协解，京口八旗二营并水师三营于镇属漕粮截留，不敷照例折给。查江安苏松两道漕项，现有减存米足敷支给，可免采买截留之类。下部议，从之。范承勋又疏江宁知府施世纶舆情爱戴，请在任守制。御史胡德迈特疏应行离任，部议解任回籍，丁母忧。御史阮尔讥疏言：我皇上御极以来，如天覆育，罔不率俾，乃冥顽如噶尔丹自外生成，致圣主赫怒，躬董六师，亲临朔漠，恩威远播，算无遗策，盖自启跸以迄回銮，往返一百日之内，跋涉五千里而遥，迅奏肤功，丕扬神武，为从古帝王所未有。请宣付史馆，敬述方略，勒成一书，布之中外，传示无穷。诏下礼部翰林议，如所请。
七月，命内阁翰林院等官修平定朔漠方略。御史龚翔麟劾奏吏部拟补拟选人员，先后互异，单月府州县缺压归双月，河工咨留人员或准或否，高下其手。尚书熊赐履窃道学虚名，负恩溺职，应与久任吏部之侍郎赵士麟严加处分。得旨：吏部回奏，复下都察院察议。寻议以回奏含糊，自相矛盾，尚书熊赐履、库埒纳，侍郎赵士麟、彭孙遹并应降三级调用。上命从宽留任。两江总督范承勋请以省仓米十万石赈淮、扬、徐灾民，复请借京口留漕、凤仓存麦接赈。得旨允行。
九月，遣官送回回国王阿卜都里什特及其子额尔克苏尔唐归国。初阿卜都里什特为噶尔丹久拘，及噶尔丹败，始脱身来归。上赐银币，遣归叶尔羌。先是，以黄、淮交涨，遣员外郎倬奇阅黄河本势。至是回奏，中河北岸之堤，未遭水患，其水已减六尺。上谕大学士等曰：向朕逆科中河北岸之堤，最为紧要，因命靳辅、于成龙加意修治，是以虽遇大水，得无妨害。历年之水，无有大于今岁者，此番无害，似可永固。黄河之水从云梯关入海，云梯关沙涨壅塞，水每为其所阻，以致退流冲决，今将淤泥挑浚，河道加深，所以水得通泄，其利普矣。厄鲁特格垒沽英塞桑等遣使请降。上巡行北塞，经理军务。壬申，启行。抚远大将军伯费扬古报：副都统祖良璧等败厄鲁特丹济拉于翁金。辛巳，京师地震。
十月，上驻跸归化城。厄鲁特降人言：噶尔丹于九月二十二日，从枯伦百尔齐尔向哈密而去。上谕乘此机会，作速剿灭，着大兵即由内地前往。
十一月，厄鲁特布达里来降，奏称：噶尔丹现存千余之兵，食用困乏，溃散及冻饿死者甚多，又火药军器遗亡殆尽，其塞桑诺尔布亦即日率众降矣。未几，果来降。戊辰，京师地微震。冬至，遣噶尔丹使人格垒沽英还，赐之敕谕，令亲身来降。先是，噶尔丹遣使纳欵，至是遣还。是日班师，驻跸黄河西界萨尔虎拖会。十二月二十日壬寅，上还宫。
康熙三十六年正月，上欲驻跸右卫易于遣调，择吉二月初六日辰时出师。谕理藩院尚书班迪等：今观噶尔丹势甚穷蹙，天与不取，坐失事机，应拨兵预备。今次出兵亦分为两路，兵各三千。寻议每兵二名，从仆一人，给马五匹，四兵合为一伍，带百日口粮。驻札肃州副都统阿（兰）［南］达疏报：擒噶尔丹之子塞卜腾巴尔珠尔于哈密之地。论抚远大将军伯费扬古知之。两江总督范承勋、河道总督董国安等疏言：会勘河道，自永安以至邳、宿二州县阎王庙一带，亟宜修筑。得旨：依所奏速行修理，云梯关乃海口要地，此处淤沙深浚，则黄河入海不致阻滞，总河每年遣才能河官专理，毋使稍有壅塞。上谕大学士等：朕观明史洪武、永乐所行之事，远迈前王。我朝现行事例，因之而行者甚多。且明代无女后预政，以臣凌君等事，但其未年坏于宦官耳。且元人讥宋，明复讥元，朕并不以前人辄讥亡国也，惟从公论耳。今编辑明史，着将此论增入明史敕书内。
二月壬午朔，钦天监预奏日食分数，谕曰：日食虽人可预算，然自古帝王，皆因此而戒惧，盖所以敬天变，修人事也，若庸主则委诸气数矣。本年水潦地震，今又日食，意必阴盛所致，岂可谓无预于人事乎？可谕九卿，如有人事应改者，悉以奏闻。丁亥，上巡兵宁夏，出德胜门，驻跸昌平州。壬寅，上驻跸榆林村前桑干河崖。奉差**喇嘛理藩院主事保住回，以第巴疏呈奏。上曰：朕阅经史，塞外蒙古多与中国抗横，自汉、唐、宋至明，俱被其害，而克宣威蒙古，并令归心如我朝者，未之有也。夫兵者凶器，圣人不得已而用之，譬之人身疮疡，方用针炙，肌肤无恙，而妄寻苦楚可乎？治天下之道亦然，乱则声讨，治则抚绥，理之自然也。自古以来，好勤远略者，国家元气，罔不亏损，是以朕意不以生事为贵。**喇嘛蒙古尊之如佛，第巴者，即代**喇嘛理事之人。噶尔丹叛逆皆第巴之故，因朕严颁谕旨，第巴悚惧，悉遵朕论，自陈乞怜，畏罪矢誓，此亦敬谨之至矣。**喇嘛身故，朕已悉知，今第巴云，遣尼麻唐胡土克图前来代彼，密陈其情，想到后必奏明连赖喇嘛已经身故，恳朕为伊掩饰，第巴既如此奏恳，事亦可行，即此可以宽宥其罪，第巴必感恩，而众蒙古亦欢悦矣。
三月，尼麻唐胡土克图至，果密奏**喇嘛身故已十六年，再生之小**喇嘛已十五岁，乞为隐讳。丁丑，驻跸宁夏，命昭武将军斯喀等穷追葛尔丹，嵩祝参赞军务。
闰三月乙未，上自宁夏往白塔，是日启行。
四月甲子，御舟泊布古图，大将军伯费扬古报：闰三月十（二）［三］日噶尔丹至阿察阿穆塔台，饮药自尽，丹济拉等携噶尔丹尸骸，及其女钟齐海来归。大臣请行庆贺礼，上曰：噶尔丹之死，乃天所助，宜先谢天。寻丹济拉奏噶尔丹尸已焚，命大将军驿递其女速来。
五月乙未，上回宫。给事中郑昱条奏平定噶尔丹庆贺大礼颁诏欵项。上曰：凡颁赦诏皆人主之事，非人臣所宜言。自古不以频赦为善政者，以其便于恶人，而无益于善人也。郑昱妄以诏欵陈奏，念系言官，特从宽宥，着大学士严饬之。礼部题平定噶尔丹武功告成，应遣官祭告，加上徽号，命史馆编辑平定北寇方略。上曰：喀尔喀厄鲁特原皆纳贡之国，因构衅致兵争，噶尔丹曾破回子中之萨马拉罕、布哈尔、哈萨克、布鲁特、叶尔钦、哈思哈尔、赛拉木、吐鲁番、哈密诸国，乃习于战斗之国，喀尔喀焉能抵敌，是以欵塞来归。其时若不允其内附，必沦入厄鲁特，允之噶尔丹必假此构难。凡此皆径熟筹，非漫然受纳也。噶尔丹假索取喀尔喀为名，犯我边境，尚书阿喇尼迎战于乌尔会之地，我师大北，噶尔丹乘势直抵乌兰布通，距京师未及七百里。斯时适朕躬以违和还京，左翼军虽能胜敌，而右翼军不能制胜，大臣而下至军士阵亡被创者甚众。噶尔丹亦自知无济，归路遭疫，得还科卜多者约不过数千人耳。当是时即预知其必称兵报复，六年以来，乌兰布通之役，时廑朕怀。正经理武备之时，噶尔丹果复举兵寇掠，喀尔喀之纳木札尔［陀音］，屯扎于克鲁伦之地。朕诏武臣三品以上咸陈方略，举朝皆以为难，其言当讨者不过四人。朕以为断当急图，遂祭告天地宗庙，我师所至，上天佑助，无水之地而灵泉涌出，不毛之地而庶草蕃芜，事悉称意。今西北永宁，其不致蒙咎者即幸矣。诸典礼俱依议行，徽号不必上。
六月，以丹济拉往投策妄阿喇布坦命阿（兰）［南］达撒噶斯口兵回，留兵马暂驻布隆吉尔等处，探听声息，井檄内大臣索额图、大将军伯费扬古、将军马思喀等从鄂尔多斯驿路而归，侍郎满丕、将军舒恕俱着回来。命大学士伊桑阿等纂修平定朔漠方略。寻马思喀等言，鄂尔多斯路远，仍率兵自鄂多里经归化城之路进张家口。
七月，以太和殿成，遣官祭告天地、宗庙、社稷。上巡幸塞外。
九月，驻跸汗特木尔达巴汉，降人厄鲁特台吉丹济拉至，授散秩大臣，安插张家口。甲午，上还官。
十月，上谕宗人府、礼部：嗣后八旗宗室子弟，有能力学属文者，应与满洲诸生一体应试，编号取中。策妄阿喇布坦执送伊拉古克三胡土克图并其弟孟克里至，磔诛之。
十一月癸巳，京师地微震。
康熙三十七年正月丁亥朔，癸卯上巡幸山西五台山，启行。
二月戊辰，上回宫。工部议覆：漕督桑额等会勘开浚下河条奏：一、高邮湖之水势宜分。一、车儿埠入海之水口宜开。一、丁溪入海之口宜通。一、小海场入海之口宜闭。一、草堰场泄水之闸宜增。一、运河之水势宜分。应令将各项工程估计具题。从之。上以朝鲜告饥，吁请于中江开市贸谷，命吏部侍郎陶岱运米三万石往朝鲜，以万石赉之，二万石平粜。寻陶岱疏言：臣于四月进中江，将赏米万石分赈，其二万石交户部侍郎贝和诺监视贸易，国王李焞具表。章下所司。御制海运朝鲜纪其事。吏部推广东按察使员缺，以甘肃西宁道刘殿衡拟正，云南粮储道张仲信拟陪，上简擢陪推之张仲信，谕奖刘殿衡曰：尔在西宁居官甚好，内外百姓，俱为称扬，遇布政使缺，即当擢用。寻授江苏布政使。
四月，上谕大学士等：广东海关收税人员，搜检商船货物，概行征税，以致商船稀少，关税缺额，且海船亦有自外国来者，如此琐屑，甚觉非（礼）［体］，着减额税银三万二百八十五两，着为令。云贵总督王继文琉：鲁魁山贼首擦揑等劫掠村堡，弩伤新折营守备张廷柱，臣会同临元总兵王洪仁遣发流士官兵剿抚，追斩贼首擦揑，余众奔溃。下部议：山林小贼，例不叙功。特旨：鲁魁贼众槃据有年，官兵剿杀可嘉，仍予议叙。
五月，云督王继文疏：鲁魁一山与哀牢相接，绵亘千余里，今贼首擦揑虽灭，余党犹存，新折一营孤悬贼窟，请设汛增兵弹压要害。查江内慢千坝乃新平县境适中之地，应拨千总一员，带兵二百名驻防。江外增设四汛，旧哈、跨果二处，各增兵一百名，大口增兵五十名，哀牢山坡之三家坡将九江协所管兵内抽调一百名，拨把总一员防守，仍归该协管辖。临元镇原设阳武坝一汛，就近归入新折营，添设参将一员，原设守备改作中军。又野贼非往新元，即奔楚景，楚姚一镇最为紧要，查援剿两协乃策应之师，各拨千总一员，各带兵二百名，一驻南安州界牌，一驻景东府福都，责令防守。又疏：贵州水西宣慰使安胜祖大为彝民之患，今已病故，请将土司停袭，所属地方改归大定、平远、黔西三州流官管辖。部议均如所请行。
七月初七日，京师地微震。直抚于成龙言：霸州等处挑浚新河已竣，乞赐河名，并敕建河神庙。得旨：赐名永定河，建庙立碑。工部议覆：漕督桑额估计开浚下河，应准行，令九卿并淮、扬等处人之在朝者，确议具奏。寻九卿奏：淮、扬人俱言开浚下河，诚为有益，然此事关系甚重，应令漕督会同总督巡抚确议具奏。从之。
八月，策妄阿拉布坦遣使同我使臣内阁侍读学士（拉）［喇］锡等来献噶尔丹骸骨，上命置京城外，悬挂示众。
十二月，副都御史吴涵言：编修、检讨等员升转壅滞，应酌量变通。编修照李涛、任楫之例，外补一二人，少詹讲读学士等官照王士祯、徐潮、顾藻、王九龄之例，以京堂各衙门调补一二人。奉上谕大学士曰：览吴涵奏，翰林官壅滞，所奏极是。翰林官员系进士选拔者，教习三年，又行考试，择其善者，始留衙门，不但伊等应升缺少，以致壅滞，即满洲、汉军翰林官亦皆壅滞，其应升缺出俱与笔帖式较俸升补，是以伊等升转甚迟，此奏朕已知之，不必令部议也。