邓继曾，字士鲁，资县人。正德十二年(1517)进士。授官行人。
世宗即位后的第四月，天久雨不晴，邓继曾上疏说：“明诏虽然颁布，但废于阁中的有一大半。大狱已定，但迟留的还不少。拟旨间出于中人，奸谀的人逐渐被宠幸而安放在皇上身边。礼有所不遵，孝有所偏重。纳谏如流，而施行得很少。这是陛下修己亲贤的诚意，逐渐不如开始，所以天降淫雨以示警戒。伏望陛下令出必信，断狱不留，事情只向辅臣咨询，宠爱不要从亲信开始，割恩以定礼，稽古以崇孝，那么一念的改变，就可以销天灾，答天戒了。”
不久，提升他为兵科给事中。他上疏陈述杜渐保终四事：一、定君心的主宰，以杜蛊惑之端；二、平均两宫的孝养，以杜嫌隙之端；三、统一政令，以杜欺蔽之端；四、清理传递的俸禄，以杜假托之端。不久又上奏说兴府跟随御驾的官不应当滥授。皇帝采纳了他的话。
嘉靖改年号，皇帝想尊生母为帝后。正巧宫中旁舍失火，廷臣大多说应归咎于“大礼”。邓继曾也说“：去年五月日精门发生火灾，今年这个月的二号长安榜廊发生火灾，而今郊祀日，内廷的小房又发生火灾。天有五行，火实主礼。人有五事，火实主言。名不正则言不顺，言不顺则礼不兴。不到一周年就发生三次火灾，这是废礼失言的效验。”提督三千营广宁伯刘佶长久养病，邓继曾疏论罢去他的职务。宣大、关陕、广西多次有警，中原盗贼兴起。邓继曾陈述战争和防守的方略以及诸将练兵足食的计策，多数都被讨论和执行。
三年(1524)，皇帝逐渐疏远大臣，政事大多宫内决断。邓继曾抗章说“：接连以来的中旨，大违王言。事情不考察经过，文章不合理要，喜欢邪说的谄媚则赐敕褒奖，厌恶辅佐的抗言则逐渐将他们流放贬黜。我看见这些就流泪、吞声。自从祖宗以来，凡有批答，一定交付内阁拟进的，不只是顾虑独见会有偏差，也防止矫伪之人的假托。正德年间，弊端已够严重了，但还没有像今天这样可怕可叹的。在皇上左右的群小，目不知书，身未经事，乘隙招权，弄笔取宠，所以他们言出无稽，一至于此。陛下不与大臣共政，而倚靠偏信群小，臣恐国家政权不安啊。”疏章呈入，皇帝震怒，将他下诏狱进行拷打治罪，谪他为金坛县丞。给事中张逵、韩楷、郑一鹏，御史林有孚、马明衡、季木都为他论救，但没有结果。他累迁至徽州知府，死去。
皇帝即位之初，大开言路。进言的人或许过于切直，皇帝也优容宽大。自从刘最和邓继曾获罪以后，皇帝就厌恶薄待言官，言官相继被废被黜，纳谏之风衰微。