郭应聘，字君宾，莆田人。嘉靖二十九年(1550)的进士。授职为户部主事。历任郎中，出京担任南宁知府。调任威茂兵备副使，转任广东参政。跟随提督吴桂芳平定李五元，攻击叛贼的首领张韶南、黄仕良等人。调任广西按察使，历任左、右布政使。隆庆四年大败古田的叛民，斩杀七千多人。此后，跟随巡抚殷正茂平定古田，再次升职晋级。
殷正茂调任总督，于是提拔郭应聘担任右副都御史接替他。府江瑶族反叛。府江，上起阳朔，下达昭平，长达三百多里。诸寨瑶民夹江居住，倚仗险隘拦路打劫。成化、正德年间，都御史韩雍、陈金讨伐并平定了他们，现在他们围攻荔浦、永安，劫持知府杨惟执、指挥胡翰。事情传出，大学士张居正上奏寻求机会，修书给郭应聘说：“炎热荒凉、瘴气缭绕的地区，动员数万人，不适宜长期逗留，迅速攻破他们的巢穴，那么其余的叛贼就会吓破胆。”郭应聘调集土兵、汉兵六万人，命令总兵官李锡率领前去讨伐。没等出发，而怀远的瑶民已经杀害了知县马希武，发动叛乱。郭应聘与殷正茂商议先征讨府江，经过三个月才全部平定，于是指令李锡讨伐怀远地区。天空下起大雨和雪，李锡无功而回。
怀远即是古时的爿羊..，地跨湖、贵靖、黎等州，环绕城郭四周的都是瑶民，国家编民又居住在他们的外围。嘉靖年间征伐怀远未能攻克，知县寄居在知府治所，遥遥显示一种管束罢了。古田被收复，瑶民慑于兵势表示愿意臣服，马希武才进入他的治所。提议修筑城池，督察过于严峻，瑶民就叛乱了，马希武被杀。到此，出师无功，郭应聘增调各路兵马，镇抚白杲、黄土、大梅、青淇等侗、僮地区，使叛贼成为孤立之势，李锡和诸将领们接连攻破叛贼的阵营，斩杀了他们的魁首，攻下怀远。事情详载于李锡传。开始商议出兵，李锡认为阳朔金宝岭的乱贼较近，想先消灭他们。郭应聘说：“你只管前去，我自有办法。”李锡出发后几天，郭应聘与按察使吴一介出其不意袭击并杀死金宝岭乱贼的首领。等到怀远被攻克，阳朔也平定了，于是分路派遣门崇文、杨照、亦孔昭等将领讨伐洛容、上油、边山。五股叛乱的瑶民全部平定。神宗很高兴，晋升他为兵部右侍郎兼右副都御史，巡抚原来的地区。
万历二年(1574)，他被召见并任命为户部右侍郎，不久，奔丧回乡。八年，他出任兵部职，兼任右佥都御史，仍然巡抚广西。当时十座瑶寨刚刚被攻下，郭应聘与总督刘尧海奏请设立隶属宾州的三个镇，由当地的人担任巡检管理它们，并统属于思恩参将，十座瑶寨因此才安定。他升任右都御史兼兵部右侍郎，统辖两广的军事事务。前任总督大都接受将领、文官的贿赂，郭应聘一概谢绝了。过了一年，皇帝召他掌管南京都察院，由吴文华接替他。不久，他就任兵部尚书，参与机要事务。此后很久，他称病回乡。
郭应聘在广西时，上奏请求恢复陈献章、王守仁的祠堂。刘台被贬斥去戍守浔州，为他租住房供应食粮，死后又出资收殓他，将他的灵柩送归故乡，自己供奉他的像以示纪念。他在南京做官，与海瑞敦促节俭，士大夫不敢侈奢。他回乡七个月后去世。赠封为太子少保，谥号襄靖。