熊文灿，贵州永宁卫人。万历三十五年(1067)中进士。初任黄州推官，后来升为礼部主事，又做过郎中。出使琉球举行加封典礼后回来，先后升为山东左参政、山西按察使、山东右布政使。因守丧弃官回乡，从此把家迁往蕲水去了。
崇祯元年(1628)，文灿起任福建布政使，未上任就在三月里改官任右佥都御史，巡抚福建。福建沿海原本有许多大盗，从袁进、李忠投降后，杨六、杨七及郑芝龙又相继起来。总兵官俞咨皋招降了杨六、杨七，芝龙还像原来一样猖獗。不过芝龙常打败都司洪先春，却放着不追；抓获官军一名游击，但不杀他；咨皋被打败后也放他逃离不追。当权者知道芝龙可以招安，就派使者过去劝降了他。文灿到来后，对芝龙很好，使他能够为自己所用。芝龙的同伙李魁奇两次投降又两次反叛，芝龙追击并活捉了他。海边的战事刚慢慢平息下来，而钟斌又起来作乱了。钟斌当初也曾接受过招安，后来又反叛，攻打福州。文灿引诱他到泉州，命令芝龙打败了他。不久把他逼到大洋里，钟斌投海死了。福建多次平息大盗都是芝龙出的力，文灿也得到记功，提升了官级。
五年(1632)二月，朝廷提升文灿为兵部右侍郎兼右佥都御史，总督两广军务，兼巡抚广东。在此之前，海盗钟凌秀投降后又反叛，被芝龙抓获，他的同伙战败后进入长汀，转移到江西所属的城镇去进行掳掠，文灿传令芝龙多次打败了他们。福建因为有红夷作乱，海盗刘香趁这个机会接连进犯福建、广东的沿海城市，庄烈帝为此批评了文灿。文灿不能讨平贼兵，就打算招降它，贼兵也假装同意他的招安。参政洪云蒸，是长沙人，起初在广西做参政，曾经搜捕过凌秀的余党，斩获过三十多首级，把贼窝全部给捣毁了。文灿竟命令云蒸与副使康承祖，参将夏之本、张一杰进入贼船中宣布指示，结果他们都给扣作人质。文灿怕自己获罪，上书说是这几位大臣相信贼兵的话，自投罗网。给事中朱国栋上书弹劾文灿，庄烈帝下诏贬了文灿的官，让他戴罪办贼，立功自赎。八年，芝龙联合广东部队在田尾岛附近的远洋中进攻刘香。刘香胁持着云蒸要求官兵停止进攻，云蒸大声喊叫说：“我誓死报国，你们马上打，勿失良机！”于是遇害了。刘香走投无路，引火自焚，溺死在大洋中。承祖等人逃脱回来了。刘香的余党一千多人后来到浙江归降，海盗才全部削平了。
文灿在福建、广东做官多年，积聚的钱财不计其数，他用大量的珍宝结交朝廷内外的权要人物，打算长期镇守岭南。恰好这时庄烈帝怀疑刘香没死，并且不了解文灿的为人，派了一名宦官借到广西采办的名义来侦察他。这位宦官来后，文灿很送了他一些礼物，留他喝了十天酒。宦官高兴之际谈到了中原地区盗贼作乱的事，文灿正值酒酣耳热，就拍案骂道“：全是那帮大臣耽误国事。如果是我文灿去，怎么会让这班盗贼猖狂成这样！”宦官站起来说“：我事实上不是去广西采办，而是奉皇上的命令来侦察你的。先生的确有盖世之才，除了你没人能惩治中原的贼寇啊。”文灿当时说话出于无意，这时后悔失言，便说办理这事有五大难、四不可。宦官说：“回去见到皇上我自己替你请求，如果皇上舍得派用先生时，先生就推辞不得啦！”文灿无言以对，只好说好吧。宦官回到宫中果然向庄烈帝讲了。早先文灿迁往蕲水后，与同乡人姚明恭结为亲家，明恭后来做了詹事，又跟杨嗣昌相好。嗣昌当时掌握着军事大权，受到庄烈帝的宠用。因为庄烈帝平贼心急，所以嗣昌希望能得到一个人帮助自己。明恭于是向他推荐了文灿，并且讲“：这个人在宫廷中可是有关系好用的。”嗣昌很高兴，于是推荐了文灿。
十年(1637)四月，庄烈帝任命文灿为兵部尚书兼右副都御史，让他接替王家桢总理南畿、河南、山西、陕西、湖广、四川军务。文灿接受任命后就请把左良玉部下的六千人作为自己的部队，又大力招募了广东及乌蛮中精通火器的一两千人，调来做自己的护卫，军事装备很是齐全。
军队驻扎在庐山时，文灿去拜访一位要好的和尚空隐。和尚一迎出来就说“：先生犯了大错呀！”文灿喝退左右，问他是什么原因这么讲。和尚说“：你认为你带领的兵能制贼兵于死地吗？”文灿说“：不能。”和尚又说“：你手下的将领中间有可以托以大事，让他独当一面，不烦你指挥就能办成事的吗？”文灿说“：没有把握。”和尚说：“二者都架不住贼寇，皇上只是看你的名声用了你，把无限希望寄托在你身上，万一你不能成功，可就要掉脑袋了！”文灿退后几步，思索良久才问道“：招安他们怎么样？”和尚说“：我料你一定招安，但是流寇跟海盗不同，你要慎重啊！”
文灿离开庐山后进驻安庆。这时庄烈帝派领勇卫营的宦官刘元斌、卢九德也到来了。良玉这员老将桀骜不驯，不愿接受文官的节制。恰好这时他的部下与广东军不和，大肆吵闹，文灿迫不得已，遣回了南方的军队。但是良玉的部队事实上不能为他所用。嗣昌对庄烈帝讲了这事，庄烈帝就让边防将领冯举、苗有才的五千人隶属文灿部下。有才在真阳战败，只有京营的将领黄得功连连打败贼兵，威名大振。
当时嗣昌提出了“四正六隅”的策略，增补了一大半官兵和军饷，试图一举消灭贼寇，贼兵相当害怕。等文灿来后，京军多次告捷，贼兵更加害怕了。只是文灿决心已定，要招降贼兵。才进驻安庆那阵，文灿就派人招降张献忠、刘国能，献忠与国能听从了招安。文灿于是大量张贴招降的檄文，又奏请把居民和粮食全都迁入城市里关闭起来，认为贼兵没有什么东西可以掠夺就会自行让步了。庄烈帝恼了，把文灿训斥了一番。嗣昌心里也不赞成文灿的办法，但既然已经任用了他，就只好设法替他辩解。根据文灿的申请，朝廷把畿辅、山西的部队各三千人拨给了他。
第二年，国能果然投降了，张献忠攻占了谷城。这时得功又在舞阳大败贼兵，马士秀、杜应金半夜里出降，信阳城拿了下来。献忠被良玉重创，几乎被抓获，他的部下饥饿、疲惫，逃走了很多人。献忠形势窘迫，也通过陈洪范投降了。这时嗣昌在评定功过时，贬了洪承畴、曹变蛟等，称赞了文灿的功绩。
后来京军解除了遂平之围，斩获了三千多贼兵首级。当时文灿在裕州，马进忠、罗汝才十三家贼兵聚结在南阳。文灿下令杀死归顺的贼兵要偿命，所以贼兵不肯听命时，官军就用金帛、酒肉犒劳他们，当时称为“求贼”。庄烈帝侦察到这种情况后说：“文灿说大话，并无其实。”文灿听说后很是害怕。孙传庭出关去攻击贼兵时，文灿没有去援救，而嗣昌这时已经进入政府中掌握了中央大权。九月，文灿驻军襄阳，贼兵分别盘踞在郧阳、襄阳一带的各处险要位置上。诸将请求出战，文灿主张兵分几路，卢九德说“：兵力分散后力量薄弱，一处失利，全军就会动摇，不如联合各部分力量一起攻打。”大家都说好，于是文灿让佥事张大任监督大将左良玉、陈洪范的军队，让通判孔贞会监督副将龙在田的军队，在双沟跟贼兵开战，大败贼兵，斩获两千多首级。罗汝才、惠登相率领的九营贼兵逃往均州，李万庆率领的三营逃往光山、固始去了。
十一月，京师戒严，朝廷召洪承畴、孙传庭入卫京师。汝才等以为要讨伐自己，非常害怕，就去求见太和山提督中官，请求接受文灿的招安，文灿同意了。他把汝才及一丈青、小秦王、一条龙四营安置在郧县，把惠登相及王国宁、常德安、杨龙贤、王光恩五营安置在均州。然后上书说“：我对李万庆、贺一龙、马光玉及临天王等主张剿灭，其他的都主张招安。我请求朝廷赦免汝才等人的罪过，授给他们一个官职。”朝廷批准了。
当时京军、良玉的军队都因入卫京师离开了，马士秀、杜应金就在许州反叛。早先，士秀等人投降后，良玉把他们的兵力安置在许州郊外。许州是个大州，良玉等将领都把自己的妻子、儿女和财物寄存在那里，良玉长久出征不回。士秀、应金在文灿的军队里，一天假装请假，借用了良玉的旗号混进许州城。夜半时分，贼兵从府中冲出，烧毁了城南的碉楼，抢劫了仓库，杀死官吏，带着财宝投奔了李万庆。万庆即贼首射塌天。
十二年(1639)三月，良玉班师回来，打败并收降了马进忠，又派刘国能进攻并招降了李万庆，士秀、应金也再次投降了。顺天王在此之前已经死去，他的同伙顺义王被部下杀死了。文灿于是上书说“：我的部队威震贼胆，投降过来的接连不断。十三家贼兵中只有革里眼、左金王及马光玉三部尚未得到应有的讨伐，不过一年半载也就可以平定了。”庄烈帝以赞许的口吻下诏书回答了他。
当初，张献忠投降后拥兵万人，盘踞在谷城，却向朝廷要十万人的粮饷。文灿及朝廷内外的要人都说给他。在他们替献忠向皇上请求官职，请求地盘，请得关防大印以后，献忠写下状子说愿意听候调遣。后来朝廷多次传檄召他的部队，他都不理，朝廷内外都知道献忠一定会反叛的。以后，汝才投降了，也不肯交出武器。等到进忠、万庆等也都投降时，文灿更自以为得法，以为天下从今往后将没有贼寇了。五月，献忠在谷城反叛，在房县劫持汝才后，九营贼兵都反了起来。最初，均州五营担心受到讨伐，犹豫不决，一起歃血结盟抵抗献忠，不久也反叛而去了。庄烈帝得知事变发生，大吃一惊，削去了文灿的官职，让他戴罪理事。七月，良玉在罗犭英山进攻献忠，被打败了。庄烈帝十分恼火，命令嗣昌来取代文灿。嗣昌来到军队中，就派遣使者把文灿逮捕入狱，判为死刑。文灿的亲戚姚明恭掌着大权也无法救他一命。十三年(1640)十月，文灿终于被处死于街市之上。