新疆之国际关系，北为帝俄，南为英国，英国之关系，则在所属印度。然当康熙、乾隆两朝，新疆初隶我版图时，其北为外蒙古，其西北为哈萨克、布鲁特，其西南为浩罕、布哈尔、巴达克山、乾竺特、阿富汗，均系我之藩属，彼此并不接壤，故交涉尚少。至同治朝，帝俄先后划去外蒙古、哈萨克、布鲁特之一部分，又先后吞并浩罕(除安集延外)、布哈尔，同时，巴达克山为阿富汗所兼并，而阿富汗又沦为英国之保护国。于是新疆之西部，完全为帝俄所包围。西南一隅，亦与英国为缘。不特此也，俄英两国亦由此发生直接关系，争欲在新疆扩张其势力，以求争衡制胜。顾英国之愿望，只在保全其印度。注450
帝俄之并浩罕也，英国独昵安集延。阿古柏之在新疆建国也，英国独加扶植，双方遣使通问，于同治十二年(1873)，签订通商条约十二条，其要点为：
(一)英国承认阿古柏为喀什噶尔及叶尔羌之爱迷儿；
(二)阿古柏承认英人在回疆有通商之权利；
(三)阿古柏承认英国在回疆有派遣使节、设置领事之权利；
(四)英货入回疆，纳值百抽二·五之税，但经喜马拉雅山运入之货，则免税；
(五)英人在回疆，享有领事裁判权。注451
此项条约，自为蔑视吾国之主权。盖乘吾有陕甘之“回乱”，无暇亦无力顾及新疆也。英国在新疆，既获有此种重大之权利，自不欲吾之收复新疆。故当左宗棠奉命岀兵关外时，英国发动若干之阻挠，适英国驻华公使馆翻译官马嘉里由印度游历云南，为腾越官兵所戕，公使威妥玛扬言，将调印度兵由缅甸图云南，并结帝俄由伊犁进兵，使我腹背受敌。其用意固在威胁清廷，对马嘉里案作有利于彼之解决，亦即在压迫清廷放弃规复新疆之企图也。注452计不得逞，在上海报纸散播谣言，如云：“喀什噶尔之酋长，已率兵入关，直抵平凉府，现有欲赴西安之意。”又云：“甘肃全省，尽为回人所踞。”又云：“喀君牙古巴之兵，已占嘉峪关，故西北各府，业经阻隔。”又云：“陕甘左伯帅所部，有粮匮兵哗之情形。”又云：“左营被喀兵隔截关外，未能回顾。”非虚张阿古柏之声势，即诬称宗棠之挫衄。盖利用吾当日西北交通之艰阻，造作不祥消息，希冀摇动清廷规复新疆之决定。注453此种谣言，既为宗棠胜利之事实所攻破，又借口马嘉里案未结，禁阻英商借款与宗棠，使缺乏军费接济，即不能继续在新疆作战。一面在上海报纸，评论吾借债用兵之非，而提供其处置新疆之主张。以为：“中国不如与欧洲各国，均不必踞有其地，于各回部中，择定最为驯良，为回人所共服者，立之为君，以为亚欧两洲枢纽之国，使为两洲不侵不叛之臣。”注454及见凡此诡计均不售，而宗棠即将进兵天山南路，威妥玛乃诣总理各国事务衙门，代阿古柏乞降，称为喀什噶尔王，俾作属国，免朝贡。且谓吾用兵日久，恐俄人乘机窜取，于印度有害，于中国边界亦必不利。总理各国事务衙门答以阿古柏为窃踞新疆南路之贼，本非属国，即言乞降，亦当缚送叛回，缴还南八城，与前敌主兵之人定议。一面遗书告宗棠，如安集延人至，戒勿加诛，宗棠覆曰：
……安集延柏霞(即夏音转)窃踞南八城及吐鲁番，并助乌垣、红庙陕甘各回为逆，中外共知。兹威妥玛等代其请降，称为喀王阿古柏，若不知吐鲁番、南八城为我疆土，柏夏为我贼也。既代其请降，又称非由其央托，既称愿降，又只请为属国，免朝贡。于归我故土，缚献逋寇，概不及之。其敢以此妄渎尊严者，意阻官军深入，与前此嗾上海申报刊播谣言，禁止洋商息借洋款，同一机局。……前闻春间敖罕旧部纠党潜袭塔什干城，杀俄人之留守旧都者，为兴复故国计。俄人旋举兵夺回塔什干城，并掳其二王子以归，未知确否。近时俄英交恶，其衅端是否因此而起，无从查询。要其怀利相接，其交久离，固可知也。威使所虑俄人从中侵占此地一节，查安集延本境，东与喀什噶尔相连，故道光年间，张格尔之变，即由此而起。其部众为军锋，张逆之踞西四城，多资其力。其东少北，近与俄新辟之境相连，顷张提军曜钞阅新来投诚之辟展人阿哈默特口供，具言帕夏现留兵在喀什噶尔西边，防俄罗斯。缘其地与俄只隔一河，时有俄人过河抢闹，是安集延畏俄之逼，在其东北紧连处所，非南八城之谓。特恐官军进攻南八城，彼首尾受敌，无以自存也。安集延既窃踞南八城，阻我进兵克复，更欲我保护彼疆，不被俄人侵扰。设心当不若是，是英人代为请降，非为安集延，乃保其印度腴疆耳。俄英共争印度，数十年矣。印度东南之地，为英所有，其北与西，为俄所有。若由东而渐及于南，英之腴疆，将折而入于俄。威使所云，与英之印度不利者，以此。至云与中国边界不利，则有不然。俄之代复伊犁，自知处非所据，原有俟乌鲁木齐、玛纳斯克复交还之约，其驻伊犁之兵，不过千人，曾于无意中询之索斯诺福斯齐及乌史漫达迷劳伏，所言皆同，可知俄于伊犁，本无久假不归之意。谓官军进规南疆，彼将乘机而收渔人之利，似与其平时以大国自居，顾惜体面不符。英人谓与中国边界不利，不过借此耸动，忌中国与俄交密，思所以离之耳。……
又函告前方老湘军统领刘锦棠曰：
……帕夏窃踞数城十余年，为我必讨之贼。官兵进讨叛回，又派兵助逆；白余等败窜南路，又复招纳隐容，该逆等向其说合求降，英人自应置之不理。况据梅翻译说，非阿古柏托人求威使说情，威使尤可不必管。如虑喀贼遣人到营，我营认作叛逆，将其杀害，我且恪遵总署钧谕，传令所部总统、分统、营官：如喀什噶尔有人来营，投递呈禀，若非带兵前来，应准其见面；如所言尚近情理，准其护送到肃州大营，听候吩呩；如无情理，即由该总总统等放回，不必杀他。至于战阵之事，权在主兵之人，非他人所可参预。用兵喀地，久暂固难逆料，阿古柏能否久驻，我亦无从悬揣。英使所虑，用兵日久，俄人从中侵占一层，似不足虑。俄人虽驻伊犁，然驻兵不过一千，近且减至八百，是原议交还一说，似非虚言。若谓更思侵占南路，无论我不能允，且俄本大国，亦断不肯自失体面，即使帕夏投诚献土，俄国亦必不受。南八城自乾隆廿四年(1759)入中国版图，至今与五印度无纤毫之损，岂贼踞此地，则于英有益，中国复此地，反于英有损乎？以此覆总署，总署即以此告威使，当不致别生枝节也。……注455
其后安集延人竟未至，达坂城之复，获阿古柏所派大通哈，遣使劝阿古柏投地请降，亦不报。
宗棠既定计进兵天山南路，安集延人又遣其党赛尔德至英，乞英代为请降。英人仍欲护持安集延，拟令缴还毗连北路数城，而留余地，俾其立国。因我国驻英公使郭嵩焘以闻，会闻阿古柏死，故嵩焘并奏言：“英人意指，尤惧俄罗斯侵有其地，谋为印度增一屏障，是以护持尤力。西路军务情形，此间一无所闻。能乘俄古柏冥殛之时，席卷扫荡，当不出此数月之内，或尚有阻滞，及时议抚，亦可省兵力，以为消弭边患之计。”诏下询宗棠，宗棠奏曰：
安集延本浩罕四部之一，浩罕为俄人所并，安集延侵我回部，谄附英人，英人阴庇之十余年，明知为我国必讨之贼，从无一语及之。上年，官军克复北路，乃为居间请许其降，而于缴回各城，缚献叛逆节目，一字不及，经总理衙门向其辩斥，乃止。兹德尔比、威妥玛复以此絮聒于郭嵩焘，以护持安集延为词，以保护立国为义，其隐情则恐安集延之为俄人所有。臣维安集延系我喀什噶尔境外部落，英、俄均我与国，英人护安集延以拒俄，我不必预闻也。英人欲护安集延，而驻兵于安集延，我亦可不预闻。至保护立国，虽是西洋通法，然安集延非无立足之地，何待英人别为立国？即别为立国，则割英地与之，或即割印度与之，可也，何为索我腴地以市恩？兹虽奉中国以建置小国之权，实则侵占中国为蚕食之计。且喀什噶尔即古之疏勒，汉代已隶中华，固我旧土也。喀什译义为各色，噶尔译义为砖房，因其地富庶多砖房，故名为喀什噶尔。南八城素以喀什噶尔、和阗、叶尔羌为最，此中外所共知者。英人以保护安集延为词，图侵我边方名城，直以喀什噶尔为帕夏固有之地，其意何居？从前恃其船炮，横行海上，犹谓只索埠头，不取土地，今则并索及疆土矣。彼阴图为印度增一屏障，公然向我商议，欲于回疆撤一屏障，此何可许？臣奉职边方，才疏德薄，致启远人轻视之心，无所逃罪。惟以局势言之，我愈示弱，彼愈逞强，势将伊于胡底？帕夏于库尔勒服毒自毙，英既有所闻，赛德尔意仍照郭嵩焘前议，德尔比意欲饬署公使傅磊斯赴总理衙门会议，茀赛斯亦拟来京调处，此皆无关紧要。彼向总理衙门陈说，总理衙门不患无词。彼来臣营陈说，臣亦有以折之。现在南路之师，刘锦棠所部之三十二营，于八月中旬，分起西进，张曜于九月初旬继进，臣前调徐占彪蜀军，移驻巴、古之间，委前寿春镇总兵易开俊率马步数营，进驻吐鲁番。与郭嵩焘片奏乘俄古柏冥殛之时，席卷扫荡一语，尚无不合。惟迫于数月之内，转战三千余里，窃恐势有难能。臣前闻英有遣淑姓赴安集延之说，已驰告刘锦棠、张曜，善为看待。如论及回疆事，则答以奉令讨贼，复我疆土，别事不敢干预。如欲议论别事，请赴肃州大营。臣于此次奉到谕旨，当加饬其体察情形，妥为经理，务期预为审量，以顾大局。……注456
然宗棠南下之师，瞬息间直抵喀什噶尔，安集延势力，消灭无余，即英国之领事与商人，亦被前敌将帅请其出境，此项交涉，不解决而自解决。
又帝俄之吞并浩罕也，阿古柏曾与帝俄恶战，身中五枪，故阿古柏对俄衔恨至深。及阿古柏建国南疆，帝俄强令通商。阿古柏曰：“我在世不过五年，请待五年后，惟命是听。”言外有“我在，不准通商”之意。故帝俄对阿古柏，亦衔恨至深。已而阿古柏又战败妥明，其势力侵入北疆，帝俄乃突以兵占我伊犁，对南疆作包围之形势。一面又遣使告阿古柏曰：“通商则和，否则战。”阿古柏不得已，许于同治十一年(1872)签订包含下列各点之条约：
(一)俄国承认阿古柏为回疆领袖；
(二)俄人在回疆任何地方，有通商及旅行之权利，回疆人民在俄境内，亦同；
(三)俄人在回疆各城市，有建造货栈及设置商务员之权利，回疆人民在俄属土耳其斯坦各埠，亦有同样权利；
(四)俄货运入回疆，及回货运入俄国，皆纳值百抽二·五之税；
(五)俄商及其驼队有通过回疆而至邻国之权利，回疆商人亦有通过俄国之权利。注457
此亦为帝俄牺牲我国主权而获得之赃物，然阿古柏不欲履行此因胁迫而成立之契约，务用种种方法，阻挠俄商入境贸易；其后与英国订约，又予英以较优惠之权利，故帝俄对阿古柏，衔恨益深。然阿古柏始终畏俄，虽得乌鲁木齐，而本人仍居南疆，亦不欲刺激帝俄太甚也。
当马嘉里案发生，英俄夹攻中国之说甚盛。帝俄适有代表索斯诺福斯齐等一行前赴西北。于是清廷疑为欲觇我虚实，诫宗棠毋示之瑕。宗棠以为西征所以规复我旧疆，原与英俄无涉；至甘肃之祸乱，已十余年，固无可掩饰，惟有坦怀待之。客索斯诺福斯齐等于陕甘总督署中，间日一会食。索斯诺福斯齐即尝带兵入伊犁者，宗棠知其谙武事，又邀其参观所属部队，所办兵工厂，诘以英俄相约之事。索斯诺福斯齐力辩其无，且言此行仅为商洽华茶径运西北输俄。宗棠以此事于我亦有利，允俟西征事定后徐议。索斯诺福斯齐知吾决定出关讨叛，自请应调为助，又愿供售枪炮弹药，宗棠均婉词谢之。又见关外粮运艰难，请代由俄境输入麦百万斤，宗棠允为承购。后伊犁俄商康密斯又售与金顺军营麦一批，于牟利之中，亦含有协助中国早日扑灭阿古柏之意，与英国护持之旨，正属相反。注458
阿古柏有子九人，长子伯克胡里，次子海古拉。阿古柏与海古拉均厚结英人，伯克胡里则谄附俄人，俄人曾嗾伯克胡里逐华人出喀什噶尔。阿古柏自杀后，海古拉为伯克胡里所戕，显为因国际间之斗争，引起家庭间之纠纷。于是官军攻下喀什噶尔，而伯克胡里投入帝俄，帝俄居之阿来。五子引上胡里，十九岁，六子迈底胡里，十四岁，八子无名，七岁，九子亦无名，四岁，又伯克胡里一子，三岁，引上胡里一子，二岁，均为官军所获。注459宗棠议依清律，处以阉割之刑，于是引起英人之非难，如上海《字林西报》云：
……左帅请阉割阿古柏子孙一奏，实骇听闻。查各国昔年皆有此事，今识见日辟，深知其非，岂中华犹未之悟耶？夫阿古柏本非叛乱之比。当中国关内未平时，喀什噶尔、安集延等处，回乱四起，阿古柏以他部之人，恃其才智，收拾残棋。数年之间，诸乱皆定，遂自立为王。英俄各国遂以王礼待之。且追溯其得踞此地，并非戎首，且实未与中国为敌。即回人之乱，亦非阿古柏唆使，故英俄皆与之立通商条约。今中国恢复故业，亦固其所，特未能明阿古柏所以自立之故，而视如叛酋，且并欲阉割其子迈底胡里等，此泰西诸国所不解也，若据万国公法，与中国相诘问，中国其何说之辞？
又有人书致《字林西报》，主张：“此事宜请驻京各国公使入朝皇太后而议之。”又有人以此絮聒于我国驻英使臣曾纪泽，纪泽讥为多事。其实无非为不获护持阿古柏在南疆之势力，致其牢骚也。注460